RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617958.4

CPEB1-215, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB1, Length 2,776 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CPEB1-215	ENST00000617958	WEE2	P0C1S8	567 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	MCF2	P10911	925 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	CD58	P19256	250 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	SHMT1	P34896	483 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	CTBS	Q01459	385 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	IKBKE	Q14164	716 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958		Q3C1V9	767 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	FAXC	Q5TGI0	409 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	VAV3	Q9UKW4	847 aa		11.02	□□□□□ -0.64
CPEB1-215	ENST00000617958	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	C7orf72	A4D263	438 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ZBTB5	O15062	677 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC22A1	O15245	554 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GRK2	P25098	689 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GCLM	P48507	274 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	TTC30A	Q86WT1	665 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	TOP1MT	Q969P6	601 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CNDP1	Q96KN2	507 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	HACD3	Q9P035	362 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		11.02	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GIPC1	O14908	333 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	PRKCH	P24723	683 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GABRB2	P47870	512 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	HSD17B4	P51659	736 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ENPEP	Q07075	957 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	WDR78	Q5VTH9	848 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	MBLAC2	Q68D91	279 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	LENG9	Q96B70	501 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	APOL6	Q9BWW8	343 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CXorf21	Q9HAI6	301 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CNTNAP1	P78357	1384 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF195	O14628	629 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	VDR	P11473	427 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GCNT1	Q02742	428 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF543	Q08ER8	600 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	KLF10	Q13118	480 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	KY	Q8NBH2	561 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CPQ	Q9Y646	472 aa		11.01	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	TMEM63A	O94886	807 aa		11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPINE1	P05121	402 aa		11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	CNTF	P26441	200 aa		11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SLC1A6	P48664	564 aa		11	□□□□□ -0.65
CPEB1-215	ENST00000617958	SERPINB9	P50453	376 aa		11	□□□□□ -0.65

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