RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.67■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 S100A5P33763 92 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 NPY2RP49146 381 aa20.67■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 APBB2Q92870 758 aa20.64■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 NUDT5Q9UKK9 219 aa20.64■□□□□ 0.89
CTDP1-208ENST00000613122 ACAP1Q15027 740 aa20.64■□□□□ 0.89
CTDP1-208ENST00000613122 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.64■□□□□ 0.89
CTDP1-208ENST00000613122 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa20.64■□□□□ 0.89
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB18Q96M61 343 aa20.64■□□□□ 0.89
CTDP1-208ENST00000613122 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.64■□□□□ 0.89
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CTDP1-208ENST00000613122 NR5A2O00482 541 aa20.63■□□□□ 0.89
CTDP1-208ENST00000613122 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
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