RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF879B4DU55 563 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SNAP23O00161 211 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 AP3D1O14617 1153 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GPD1P21695 349 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PTGER2P43116 358 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GPD2P43304 727 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SIK1P57059 783 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TRIM2Q9C040 744 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ADPRHL2Q9NX46 363 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GGA3Q9NZ52 723 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 LOC100653049A0A140TA62 436 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PCSK1P29120 753 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CDH4P55283 916 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SMIM11AP58511 58 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 IL2P60568 153 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PDIA6Q15084 440 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 FIGNQ5HY92 759 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PACS1Q6VY07 963 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SMYD1Q8NB12 490 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 OR7A2PQ8NGA2 310 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 YIPF2Q9BWQ6 316 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DGAT1O75907 488 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DDHD2O94830 711 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PTENP60484 403 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 OTOAQ7RTW8 1153 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ARHGEF19Q8IW93 802 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 AGAP3Q96P47 875 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PLGRKTQ9HBL7 147 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ATXN10Q9UBB4 475 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PLK4O00444 970 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RGS14O43566 566 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 HS6ST1O60243 411 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CDH3P22223 829 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CKAP2Q8WWK9 683 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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PTPRT-209ENST00000612229 NR5A2O00482 541 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RARBP10826 455 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ITIH1P19827 911 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.13□□□□□ -1.27
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PTPRT-209ENST00000612229 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ADCK2Q7Z695 626 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 VMP1Q96GC9 406 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 C2CD2Q9Y426 696 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 OR14I1A6ND48 311 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L15C9J2P7 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L11C9JVI0 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L18D6R9N7 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L22D6RA61 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L19D6RCP7 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L20D6RJB6 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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PTPRT-209ENST00000612229 CRTAMO95727 393 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 ALOX12P18054 663 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 CSNK2BP67870 215 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L24Q0WX57 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 DLG1Q12959 904 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 BOLA3Q53S33 107 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 USP17L6PQ6QN14 398 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 AAASQ9NRG9 546 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 XPR1Q9UBH6 696 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 FAM20BO75063 409 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRT-209ENST00000612229 GZMAP12544 262 aa7.13□□□□□ -1.27
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