RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 FYNP06241 537 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 EPHX1P07099 455 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 KRT5P13647 590 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SLC6A4P31645 630 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GPD2P43304 727 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TPMTP51580 245 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TBX4P57082 545 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ARID5AQ03989 594 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ST3GAL2Q16842 350 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 MPP7Q5T2T1 576 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PIK3R6Q5UE93 754 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 RFWD3Q6PCD5 774 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 CHST9Q7L1S5 443 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ADIPOR2Q86V24 386 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 CACUL1Q86Y37 369 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TMPRSS6Q8IU80 811 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 UNC45BQ8IWX7 931 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 AHI1Q8N157 1196 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 DEFB124Q8NES8 71 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 WFDC5Q8TCV5 224 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GOLGA1Q92805 767 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FOXJ1Q92949 421 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 MIS12Q9H081 205 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ABCB8Q9NUT2 735 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GGA2Q9UJY4 613 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 IGF2RP11717 2491 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ZZEF1O43149 2961 aa9.96□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 MEI4A8MW99 385 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 UPK3BL1B0FP48 263 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 UPK3BL2E5RIL1 263 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ARHGAP33O14559 1287 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 IRAK2O43187 625 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SART1O43290 800 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ACSL4O60488 711 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 OPHN1O60890 802 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TBL1XO60907 577 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SYPP08247 313 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ATXN8OSP0DMR3 200 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 C7P10643 843 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ACADMP11310 421 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 HLA-EP13747 358 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 OXTRP30559 389 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ACADSBP45954 432 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SLC11A2P49281 568 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SEMA3BQ13214 749 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 NNTQ13423 1086 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 MEA1Q16626 185 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PTPRNQ16849 979 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PLEKHG6Q3KR16 790 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 DENND1BQ6P3S1 775 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PIP4P1Q86T03 277 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 OR2T3Q8NH03 318 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 AZIN2Q96A70 460 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FAM149B1Q96BN6 582 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SERPINB11Q96P15 392 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 GPR174Q9BXC1 333 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TMEM245Q9H330 911 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 SLC32A1Q9H598 525 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 ST7Q9NRC1 585 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 RWDD2AQ9UIY3 292 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 WASF3Q9UPY6 502 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.95□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.94□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 PTPRBP23467 1997 aa9.94□□□□□ -0.82
HCG18-247ENST00000602698 DOCK4Q8N1I0 1966 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms