RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 NME3Q13232 169 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DPYSL3Q14195 570 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KRT81Q14533 505 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 C10orf120Q5SQS8 335 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.48□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 BBS12Q6ZW61 710 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC185Q8N715 623 aa8.48□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SPATA4Q8NEY3 305 aa8.48□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 HSPH1Q92598 858 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CAPZA3Q96KX2 299 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PSMB7Q99436 277 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EPAS1Q99814 870 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DCLK3Q9C098 648 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TKTL2Q9H0I9 626 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EPOPA6NHQ4 379 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KRIT1O00522 736 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CCL16O15467 120 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 COCHO43405 550 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PHF2O75151 1096 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 APOC2P02655 101 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SPATA31D3P0C874 917 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CHRNA3P32297 505 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.47□□□□□ -1.051e-7■■■■□ 26.4
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KDM5B-210ENST00000602511 NRIP1P48552 1158 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NR2C2P49116 596 aa8.47□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 EFEMP1Q12805 493 aa8.47□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.47□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 GAREM2Q75VX8 874 aa8.47□□□□□ -1.05
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KDM5B-210ENST00000602511 ADAM32Q8TC27 787 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLCO2A1Q92959 643 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RNF34Q969K3 372 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MS4A14Q96JA4 679 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RNF157Q96PX1 679 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CARD6Q9BX69 1037 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 CALN1Q9BXU9 219 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 NACA2Q9H009 215 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RAB6CQ9H0N0 254 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 LRRC19Q9H756 370 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.47□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.46□□□□□ -1.05
KDM5B-210ENST00000602511 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa8.46□□□□□ -1.06
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.46□□□□□ -1.06
KDM5B-210ENST00000602511 SLC12A8A0AV02 714 aa8.46□□□□□ -1.06
KDM5B-210ENST00000602511 WASH4PA8MWX3 477 aa8.46□□□□□ -1.06
KDM5B-210ENST00000602511 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
KDM5B-210ENST00000602511 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
KDM5B-210ENST00000602511 KRT37O76014 449 aa8.46□□□□□ -1.06
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