RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB8Q9NUT2 735 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD3Q9Y2F9 522 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ATRXP46100 2492 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 E7ENQ6 273 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 FLRT2O43155 660 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MSI1O43347 362 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 C7P10643 843 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 KIF19Q2TAC6 998 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF139Q8WU17 664 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 GGA2Q9UJY4 613 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX11Q9Y5W9 270 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 STX10O60499 249 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT85P78386 507 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAP1Q15027 740 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SGO2Q562F6 1265 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 LAYNQ6UX15 382 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 UBA3Q8TBC4 463 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 WFDC5Q8TCV5 224 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 RHBDD1Q8TEB9 315 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS16Q9NQE7 514 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PLA2G4CQ9UP65 541 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BAHCC1Q9P281 2608 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 DKK1O94907 266 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF445P59923 1031 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS14P62263 151 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CUL2Q13617 745 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRF1Q5T601 910 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 AHI1Q8N157 1196 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BIRC7Q96CA5 298 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 TM9SF3Q9HD45 589 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 HESX1Q9UBX0 185 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CETN3O15182 167 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA4FO95754 770 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 LATS1O95835 1130 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CD19P15391 556 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MBLAC2Q68D91 279 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MARCH9Q86YJ5 346 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC6Q99741 560 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD1Q9H0C5 482 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 DSPP15924 2871 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA8CPA6NN73 597 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 COL28A1Q2UY09 1125 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 TCERG1LQ5VWI1 586 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 OSGEPQ9NPF4 335 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.71■■□□□ 1.87
CAPNS1-211ENST00000590874 O00370 1275 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNK3O14649 394 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GABBR2O75899 941 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FSBPO95073 299 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DLDP09622 509 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LCP1P13796 627 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CD70P32970 193 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIA4P48058 902 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DAOAP59103 153 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TEAD4Q15561 434 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PKDCCQ504Y2 493 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNT1Q5JUK3 1230 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RFWD3Q6PCD5 774 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 UBR7Q8N806 425 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MTG2Q9H4K7 406 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FBRSQ9HAH7 460 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RAXQ9Y2V3 346 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMA5O15230 3695 aa26.7■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQ27 194 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQ64 194 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF202O95125 648 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DNTTP04053 509 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SETSIPP0DME0 302 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 VDRP11473 427 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A4P31645 630 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB16Q05516 673 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MSANTD2Q6P1R3 559 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZD3Q86UT5 571 aa26.69■■□□□ 1.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SCML4Q8N228 414 aa26.69■■□□□ 1.86
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