RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589475.1

EFTUD2-213, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 200 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-213ENST00000589475 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RASAL2Q9UJF2 1139 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 USP18Q9UMW8 372 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TFR2Q9UP52 801 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF510Q9Y2H8 683 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DENND4CQ5VZ89 1909 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A0U1RQJ8 604 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 A0A1W2PRU2 124 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC12A8A0AV02 714 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF487B1APH4 448 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 COCHO43405 550 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TADA3O75528 432 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 OLFM2O95897 454 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 FTCDO95954 541 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CKMP06732 381 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 FOSL2P15408 326 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TCF3P15923 654 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PRLRP16471 622 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HDCP19113 662 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MIPP30301 263 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC11A2P49281 568 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CXCR3P49682 368 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HDAC4P56524 1084 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC7A9P82251 487 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 OGDHQ02218 1023 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EFEMP1Q12805 493 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 NME3Q13232 169 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ADGRE1Q14246 886 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PDK2Q15119 407 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CDO1Q16878 200 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GPR158Q5T848 1215 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SYPL2Q5VXT5 272 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRNP1Q6NT89 227 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SCYL2Q6P3W7 929 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RNF135Q8IUD6 432 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 KATNAL2Q8IYT4 538 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 EXD1Q8NHP7 514 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SHKBP1Q8TBC3 707 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 MAIP1Q8WWC4 291 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ATRIPQ8WXE1 791 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CD101Q93033 1021 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 AZIN2Q96A70 460 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 E2F7Q96AV8 911 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PBKQ96KB5 322 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BTBD6Q96KE9 485 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 HAPLN3Q96S86 360 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRIM7Q9C029 511 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CARD9Q9H257 536 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RETREG1Q9H6L5 497 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 WDCPQ9H6R7 721 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CCSER2Q9H7U1 834 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TRPC7Q9HCX4 862 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PIGVQ9NUD9 493 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 OSER1Q9NX31 292 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CLDND1Q9NY35 253 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 OBP2AQ9NY56 170 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 RNF14Q9UBS8 474 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 DNAI1Q9UI46 699 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 CD207Q9UJ71 328 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 FAM50BQ9Y247 325 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 USTQ9Y2C2 406 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 LAMA3Q16787 3333 aa5.66□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 OBSL1O75147 1896 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 E2F8A0AVK6 867 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 C2orf78A6NCI8 922 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 H3BRJ5 948 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-213ENST00000589475 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms