RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 KCNJ12Q14500 433 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MCM6Q14566 821 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF234Q14588 700 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 STAT4Q14765 748 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TESK1Q15569 626 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GEN1Q17RS7 908 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CFAP221Q4G0U5 840 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HECTD3Q5T447 861 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 AP1ARQ63HQ0 302 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ICE2Q659A1 982 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CSPG4Q6UVK1 2322 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SPNS3Q6ZMD2 512 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HTR3DQ70Z44 454 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SV2AQ7L0J3 742 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 RAB11FIP2Q7L804 512 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DSG4Q86SJ6 1040 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TAX1BP1Q86VP1 789 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LCA5Q86VQ0 697 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DTX1Q86Y01 620 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 HSCBQ8IWL3 235 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TP53INP2Q8IXH6 220 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SLFN12Q8IYM2 578 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ADGRF2Q8IZF7 708 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MFSD2AQ8NA29 543 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UNC13CQ8NB66 2214 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC148Q8NFR7 591 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 IFI44Q8TCB0 444 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CPT1CQ8TCG5 803 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GANCQ8TET4 914 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 BHMTQ93088 406 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GTF3C6Q969F1 213 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SNX21Q969T3 373 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 WBP2Q969T9 261 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FAM212AQ96EL1 285 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TCTN2Q96GX1 697 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SPATA17Q96L03 361 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 CATSPER2Q96P56 530 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PPP1R9BQ96SB3 815 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ACBD6Q9BR61 282 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LNPKQ9C0E8 428 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 NEUROG2Q9H2A3 272 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 RASSF4Q9H2L5 321 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 OSBPL3Q9H4L5 887 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 USP29Q9HBJ7 922 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PREBQ9HCU5 417 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SH3GLB2Q9NR46 395 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 LATS2Q9NRM7 1088 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PKDREJQ9NTG1 2253 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EVA1BQ9NVM1 165 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KLHL11Q9NVR0 708 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UCKL1Q9NWZ5 548 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 FBXL12Q9NXK8 326 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PLK2Q9NYY3 685 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EHD2Q9NZN4 543 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MARK1Q9P0L2 795 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ACSL6Q9UKU0 697 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SUFUQ9UMX1 484 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHA4Q9UN74 947 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHA12Q9UN75 941 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ENTPD4Q9Y227 616 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 U3KQA8 63 aa2.55□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 JMJD1CQ15652 2540 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 MYH10P35580 1976 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ANK1P16157 1881 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 PTPRJQ12913 1337 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 UQCRHLA0A096LP55 91 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 A0A1W2PQ27 194 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 A0A1W2PQ64 194 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 A0A1W2PQC6 194 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 BICDL2A1A5D9 508 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ARHGEF35A5YM69 484 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 ERICH4A6NGS2 130 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 EFCAB7A8K855 629 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 KPNA7A9QM74 516 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TCP11X1B4DZS4 312 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa2.54□□□□□ -2
SNORD53-201ENST00000579969 K7EM74 188 aa2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms