RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577887.1

SNORD53B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53B, Length 78 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53B-201ENST00000577887 CYP26A1O43174 497 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SLC7A4O43246 635 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 MAP3K7O43318 606 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 THAP12O43422 761 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 EDIL3O43854 480 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 PCDHGA12O60330 932 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 TSPAN3O60637 253 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 DTNBO60941 627 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ATP2C2O75185 946 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 MOSPD3O75425 235 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 STC2O76061 302 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GJB6O95452 261 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ADCY5O95622 1261 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 STAU1O95793 577 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 TBX18O95935 607 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 F9P00740 461 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ASS1P00966 412 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 LTFP02788 710 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 PRNPP04156 253 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 NTRK1P04629 796 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ANXA6P08133 673 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 RHOCP08134 193 aa1.63□□□□□ -2.15
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SNORD53B-201ENST00000577887 DLDP09622 509 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ALPIP09923 528 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 VDRP11473 427 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 TDGF1P13385 188 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC130P13994 396 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GOT1P17174 413 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CKMT2P17540 419 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GABRG2P18507 467 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 NDUFV2P19404 249 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SPINK2P20155 84 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SYT1P21579 422 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 C5AR1P21730 350 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 BCKDHBP21953 392 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CA4P22748 312 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 KELP23276 732 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GLDCP23378 1020 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CD27P26842 260 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 MAOBP27338 520 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ADSSP30520 456 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 HOXC13P31276 330 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CCR1P32246 355 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SLC8A1P32418 973 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 NOS2P35228 1153 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 OPRD1P41143 372 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 IL12RB1P42701 662 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SLC6A11P48066 632 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GCLMP48507 274 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 PSMD8P48556 350 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ATP1A2P50993 1020 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 DNA2P51530 1060 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 TPMTP51580 245 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CCR5P51681 352 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 KIF11P52732 1056 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 RPS21P63220 83 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 TPM4P67936 248 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CXADRP78310 365 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ECT2LQ008S8 904 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 KCNC4Q03721 635 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 PTK2Q05397 1052 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GRIN1Q05586 938 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 LRRC63Q05C16 580 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 RING1Q06587 406 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CYP4F3Q08477 520 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ADIGQ0VDE8 80 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CCDC173Q0VFZ6 552 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SCAPQ12770 1279 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 MAPK7Q13164 816 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SEMA3BQ13214 749 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 FZD5Q13467 585 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CUL4BQ13620 913 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SEPT6Q14141 434 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ARHGEF7Q14155 803 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 SPIDRQ14159 915 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GAS6Q14393 721 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ZNF234Q14588 700 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GRM3Q14832 879 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 NR0B2Q15466 257 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CST6Q15828 149 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 COL28A1Q2UY09 1125 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 HLA-BQ31612 363 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 EDRF1Q3B7T1 1238 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 MAP7D1Q3KQU3 841 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 ZACNQ401N2 412 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 FUT11Q495W5 492 aa1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
SNORD53B-201ENST00000577887 EFHC1Q5JVL4 640 aa1.63□□□□□ -2.15
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