RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 NINJ2Q9NZG7 142 aa30.07■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SOAT2O75908 522 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1D2P34982 312 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEA4P43358 317 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 DSG1Q02413 1049 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 AGBL2Q5U5Z8 902 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 TTC25Q96NG3 672 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 HSFX1Q9UBD0 423 aa30.06■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAM21Q9UKJ8 722 aa30.06■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SHBGP04278 402 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC2A3P11169 496 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARL4CP56559 192 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR152Q8TDT2 470 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 HTR3CQ8WXA8 447 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 SAYSD1Q9NPB0 183 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPG21Q9NZD8 308 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 TLR6Q9Y2C9 796 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACRP10323 421 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GLUD2P49448 558 aa30.05■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 NRLP54845 237 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 KLC2Q9H0B6 622 aa30.05■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRIG2O94898 1065 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACSL3O95573 720 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAF10Q12962 218 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 HIF1AQ16665 826 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANKRD22Q5VYY1 191 aa30.04■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRD8Q9H0E9 1235 aa30.04■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ALOX15BO15296 676 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 MSI1O43347 362 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 EPHB2P29323 1055 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 GYS2P54840 703 aa30.03■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 KCNJ11Q14654 390 aa30.03■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TTLL2Q9BWV7 592 aa30.03■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C6orf118Q5T5N4 469 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 YME1L1Q96TA2 773 aa30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 C2CD2LO14523 706 aa30.02■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATF6P18850 670 aa30.02■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC39A13Q96H72 371 aa30.02■■■□□ 2.4
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CTDNEP1-208ENST00000573600 URODP06132 367 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-208ENST00000573600 VAV1P15498 845 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-208ENST00000573600 AP1B1Q10567 949 aa30■■■□□ 2.39
CTDNEP1-208ENST00000573600 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.392e-6■■■□□ 18
CTDNEP1-208ENST00000573600 TERF2Q15554 542 aa30■■■□□ 2.39
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