RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	KATNBL1	Q9H079	304 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		18.96	■□□□□ 0.63
RRN3-205	ENST00000563559	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MMP3	P08254	477 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	VAV1	P15498	845 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	AXL	P30530	894 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	INSC	Q1MX18	579 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PACS1	Q6VY07	963 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	APPL2	Q8NEU8	664 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf21	Q9H246	121 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GINS2	Q9Y248	185 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RNF103	O00237	685 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RECQL4	O94761	1208 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KIT	P10721	976 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SULT1E1	P49888	294 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CES4A	Q5XG92	561 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FAM131B	Q86XD5	332 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LGMN	Q99538	433 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		18.95	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN9	O14815	690 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DAB1	O75553	588 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CIB2	O75838	187 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ABL2	P42684	1182 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	AP1B1	Q10567	949 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TREML1	Q86YW5	311 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB106A	Q8N104	65 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	P2RY11	Q96G91	374 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF333	Q96JL9	665 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GPR32	O75388	356 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KRT36	O76013	467 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	POLB	P06746	335 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SKI	P12755	728 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GRK2	P25098	689 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LMO2	P25791	158 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TAF6	P49848	677 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SV2C	Q496J9	727 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MBLAC2	Q68D91	279 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RNF139	Q8WU17	664 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SETD4	Q9NVD3	440 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	HES2	Q9Y543	173 aa		18.94	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	MFSD11	O43934	449 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	HUS1	O60921	280 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TM7SF2	O76062	418 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	AOC1	P19801	751 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NOS2	P35228	1153 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SESN3	P58005	492 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PDE1B	Q01064	536 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RCN2	Q14257	317 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NT5C3B	Q969T7	300 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	FAM161B	Q96MY7	647 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAT	Q9P243	1243 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		18.93	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	TPP1	O14773	563 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	PLIN3	O60664	434 aa		18.92	■□□□□ 0.62
RRN3-205	ENST00000563559	KLHL2	O95198	593 aa		18.92	■□□□□ 0.62

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