RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	SNRPF	P62306	86 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CREM	Q03060	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SV2C	Q496J9	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LIN9	Q5TKA1	542 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DPH6	Q7L8W6	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KCT2	Q8NC54	265 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DERA	Q9Y315	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	SNX9	Q9Y5X1	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATXN3-231	ENST00000554994	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994		K7ESF4	209 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PIR	O00625	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMA7	O14818	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NDUFB5	O43674	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM189A1	O60320	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	HPX	P02790	462 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CELA3B	P08861	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYL4	P12829	197 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPN2	P17706	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	LRPAP1	P30533	357 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PNPLA4	P41247	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GCLM	P48507	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	VAMP7	P51809	220 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYL6	P60660	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TNNC1	P63316	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NTHL1	P78549	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	MYL7	Q01449	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CFHR1	Q03591	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNB1	Q14721	858 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	PSMD6	Q15008	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATXN3-231	ENST00000554994	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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