RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 MAP2K2P36507 400 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 XRCC4Q13426 336 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF534Q76KX8 674 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 OSER1Q9NX31 292 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PHF24Q9UPV7 400 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TSC2P49815 1807 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 DRD4P21917 467 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 EPHB2P29323 1055 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 ATP5DP30049 168 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CDK7P50613 346 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 SCD5Q86SK9 330 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TRABDQ9H4I3 376 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa21.61■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TNFRSF10BO14763 440 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 LRIG2O94898 1065 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 USP46P62068 366 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CASP10Q92851 521 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 C5orf60A6NFR6 353 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TYMPP19971 482 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CXCR3P49682 368 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 WASHC5Q12768 1159 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 SEMA3BQ13214 749 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 DEFB128Q7Z7B8 93 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CENPTQ96BT3 561 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 AGAP3Q96P47 875 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1W2PQH9 124 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 NDC80O14777 642 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 INPPL1O15357 1258 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 UPP2O95045 317 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PHBP35232 272 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 UGT1A9O60656 530 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PSMB4P28070 264 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF567Q8N184 647 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CASD1Q96PB1 797 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 UGT1A7Q9HAW7 530 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 UGT1A10Q9HAW8 530 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 UGT1A8Q9HAW9 530 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 FAM169AQ9Y6X4 670 aa21.59■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 A0A0A0MRY4 1105 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 TCP11X1B4DZS4 312 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 KRT4P19013 534 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 MSH2P43246 934 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 NUMBP49757 651 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 ARL13BQ3SXY8 428 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PID1Q7Z2X4 250 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 CTAGE3PQ8IX95 158 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 NTAN1Q96AB6 310 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 SPATA13Q96N96 652 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 SLC9A7Q96T83 725 aa21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PRDM4-205ENST00000550376 USP12O75317 370 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 OAZ2O95190 189 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TBX18O95935 607 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 IFT88Q13099 833 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 DCAKDQ8WVC6 231 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.58■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 GNRH1P01148 92 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SLC11A1P49279 550 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 PDK1Q15118 436 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 SCAPQ12770 1279 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.57■■□□□ 1.04
PRDM4-205ENST00000550376 TDRPQ86YL5 185 aa21.57■■□□□ 1.04
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