RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520429.5

CCNC-210, Transcript of cyclin C, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNC, Length 2,473 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-210ENST00000520429 NR2C2P49116 596 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ARCQ7LC44 396 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 BNIPLQ7Z465 357 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ZNF567Q8N184 647 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 NPWQ8N729 165 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SPATA13Q96N96 652 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 AGAP3Q96P47 875 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 RRAGCQ9HB90 399 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 PLLPQ9Y342 182 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CDY2AQ9Y6F7 541 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TSC2P49815 1807 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 F8W810 466 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 DAB1O75553 588 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 PGK1P00558 417 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TPSB2P20231 275 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 PNPLA4P41247 253 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SNX16P57768 344 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CDC42EP1Q00587 391 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 DEUP1Q05D60 604 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TPSAB1Q15661 275 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 NDUFAF2Q8N183 169 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 HASPINQ8TF76 798 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 MIPEPQ99797 713 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ZNF487B1APH4 448 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SPAG6O75602 509 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 KITP10721 976 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 DESP17661 470 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 LRPAP1P30533 357 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 NOS2P35228 1153 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 BST1Q10588 318 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CBLBQ13191 982 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SYBUQ9NX95 663 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ARMCX1Q9P291 453 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 AP1G2O75843 785 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CHRNA1P02708 482 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SCNN1AP37088 669 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CPT1AP50416 773 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SCNN1GP51170 649 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 HUNKP57058 714 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 RIPK1Q13546 671 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 DPYSQ14117 519 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 WLSQ5T9L3 541 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CHSY1Q86X52 802 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 LRMDAQ9H2I8 198 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.47□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TTC3P53804 2025 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 DCLK1O15075 740 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 DCTN3O75935 186 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 KRT37O76014 449 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 GSRP00390 522 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 MYL2P10916 166 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ERCC2P18074 760 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ALDH3A1P30838 453 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 HOXC8P31273 242 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 ABCG1P45844 678 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 CHI3L2Q15782 390 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 PPM1JQ5JR12 505 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 FYB2Q5VWT5 728 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 RFX8Q6ZV50 586 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 FAM35AQ86V20 835 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 TMEM209Q96SK2 561 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.46□□□□□ -0.09
CCNC-210ENST00000520429 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CCNC-210ENST00000520429 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CCNC-210ENST00000520429 FAM200BP0CF97 657 aa14.46□□□□□ -0.1
CCNC-210ENST00000520429 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.1
CCNC-210ENST00000520429 ERVK-10P10266 1014 aa14.46□□□□□ -0.1
CCNC-210ENST00000520429 NCAM1P13591 858 aa14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms