RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	HSPA7	P48741	367 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	RAB30	Q15771	203 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	P3H1	Q32P28	736 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FAM47B	Q8NA70	645 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		4.78	□□□□□ -1.64
MATR3-223	ENST00000514402	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402		J3KTA2	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ALAD	P13716	330 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SCP2	P22307	547 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	AGTR2	P50052	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	MMP21	Q8N119	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TAF5L	O75529	589 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TOMM40	O96008	361 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NPPB	P16860	134 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TRBV5-3	A0A0A0MS03	114 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402		M0QZQ0	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PCDH17	O14917	1159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NKX2-8	O15522	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ANXA6	P08133	673 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TLE3	Q04726	772 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	DLGAP5	Q15398	846 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LIPM	Q5VYY2	423 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM38	O00635	465 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PPP6R2	O75170	966 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PSG1	P11464	419 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	IGFBP2	P18065	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TGM2	P21980	687 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FHL1	Q13642	323 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-223	ENST00000514402	TP63	Q9H3D4	680 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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