RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 FZD3Q9NPG1 666 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PROCRQ9UNN8 238 aa4.75□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 KCNQ3O43525 872 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 VIPP01282 170 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 STT3AP46977 705 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 KCNJ4P48050 445 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PGGT1BP53609 377 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 P2RX3P56373 397 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 GAD2Q05329 585 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 DMWDQ09019 674 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ATP1A4Q13733 1029 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 RAP1GAP2Q684P5 730 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 TTC30AQ86WT1 665 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 GLMPQ8WWB7 406 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 LPAR1Q92633 364 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PIMREGQ9BSJ6 248 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.74□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 A0A0G2JK05 382 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 APOL1O14791 398 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 SGPL1O95470 568 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 CIITAP33076 1130 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 POLD2P49005 469 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PGM5Q15124 567 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 SLC5A9Q2M3M2 681 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF585BQ52M93 769 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ISM2Q6H9L7 571 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 LRIG3Q6UXM1 1119 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA0408Q6ZU52 694 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 DGKHQ86XP1 1220 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 LAS2Q8IYD9 372 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 FAM47BQ8NA70 645 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 EME1Q96AY2 570 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 GPR78Q96P69 363 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ELOVL1Q9BW60 279 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.73□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 A0A1W2PPC4 97 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 H0YGN5 161 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 HOXB2P14652 356 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 EGR1P18146 543 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 CASP5P51878 434 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 DDIASQ8IXT1 998 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 TXLNBQ8N3L3 684 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 RNF152Q8N8N0 203 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 COLEC11Q9BWP8 271 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 FAM50BQ9Y247 325 aa4.72□□□□□ -1.65
UBE2B-202ENST00000499038 OR2W5A6NFC9 320 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 A6NNC1 897 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 RHODO00212 210 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 ATG13O75143 517 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 NDST3O95803 873 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 NGFRP08138 427 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 CHRNB1P11230 501 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 GABRB3P28472 473 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 PRIM2P49643 509 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 ZXDBP98169 803 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF479Q96JC4 524 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.7□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 NPC1O15118 1278 aa4.7□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 RFPL3SP0C7P2 107 aa4.7□□□□□ -1.66
UBE2B-202ENST00000499038 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms