RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	FBXO43	Q4G163	708 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	MPPE1	Q53F39	396 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RAB6C	Q53S08	254 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	LGI2	Q8N0V4	545 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TERB1	Q8NA31	727 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SIK2	Q9H0K1	926 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.19	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PAGE1	O75459	146 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CISD3	P0C7P0	127 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SLC2A3	P11169	496 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TACR2	P21452	398 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SDC4	P31431	198 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	WAS	P42768	502 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CCR3	P51677	355 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TRIM14	Q14142	442 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PPP2R5D	Q14738	602 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	GEN1	Q17RS7	908 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	WDR59	Q6PJI9	974 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	VPS36	Q86VN1	386 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	FAM131B	Q86XD5	332 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ALLC	Q8N6M5	410 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	USP33	Q8TEY7	942 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	AZIN2	Q96A70	460 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	MCEE	Q96PE7	176 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	KCNH6	Q9H252	994 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	WDCP	Q9H6R7	721 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ANKRD62	A6NC57	917 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PRRT4	C9JH25	899 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024		F5H5T6	163 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	GFRA2	O00451	464 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ATG13	O75143	517 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RTN2	O75298	545 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	F9	P00740	461 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SP9	P0CG40	484 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	GZMA	P12544	262 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	GPD1	P21695	349 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TNFRSF4	P43489	277 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CXCR3	P49682	368 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	NUMB	P49757	651 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF75D	P51815	510 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	DMWD	Q09019	674 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	CCDC14	Q49A88	953 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	C14orf80	Q86SX3	495 aa		10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
CALD1-223	ENST00000496024	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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