RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF34	Q969K3	372 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PIF1	Q9H611	641 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PHF24	Q9UPV7	400 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0J9YVX5	310 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ITGB3	P05106	788 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MPST	P25325	297 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ETV4	P43268	484 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	CCR10	P46092	362 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NR1H2	P55055	460 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	NME3	Q13232	169 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC12A1	Q13621	1099 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PGM5	Q15124	567 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	USP33	Q8TEY7	942 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	OMD	Q99983	421 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	SELENON	Q9NZV5	590 aa		10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
ERCC3-208	ENST00000491292	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PIGN	O95427	931 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MMP10	P09238	476 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PIK3R1	P27986	724 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	TCEAL1	Q15170	157 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	DGKD	Q16760	1214 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC38	Q5VT99	294 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	HDAC11	Q96DB2	347 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ATG4C	Q96DT6	458 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A096LPK6	155 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FUT4	P22083	530 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PLK1	P53350	603 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC18A2	Q05940	514 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	XKR3	Q5GH77	459 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	GPR107	Q5VW38	600 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM131B	Q86XD5	332 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	LGMN	Q99538	433 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	DMTF1	Q9Y222	760 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CDYL	Q9Y232	598 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PCDHGB5	Q9Y5G0	923 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM149A	A5PLN7	773 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF839	A8K0R7	811 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	RFPL1	O75677	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ERBB2	P04626	1255 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ICAM1	P05362	532 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PRKCB	P05771	671 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PDGFRB	P09619	1106 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	OCM2	P0CE71	109 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	NR4A1	P22736	598 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CHRNA5	P30532	468 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ENTPD1	P49961	510 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC5A3	P53794	718 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	GBE1	Q04446	702 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM47B	Q8NA70	645 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	BFAR	Q9NZS9	450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		10.08	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	CRCP	O75575	148 aa		10.07	□□□□□ -0.8
ERCC3-208	ENST00000491292	METTL18	O95568	372 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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