RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL23A	Q9NPF7	189 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MARCH5	Q9NX47	278 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CEP72	Q9P209	647 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KAT6A	Q92794	2004 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	USP27X	A6NNY8	438 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	STX10	O60499	249 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DGKI	O75912	1065 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GFPT2	O94808	682 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNNC2	P02585	160 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOD2	P04179	222 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAC2	P15153	192 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNLIP	P16233	465 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRK2	P25098	689 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFC2	P35250	354 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRK3	P35626	688 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC11A1	P49279	550 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDR1	P51861	262 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP3M2	P53677	418 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LILRA4	P59901	499 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBP5	P82980	135 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GCNT1	Q02742	428 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUL2	Q13617	745 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SURF1	Q15526	300 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	UPP1	Q16831	310 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DRC7	Q8IY82	874 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUP43	Q8NFH3	380 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEK11	Q8NG66	645 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYLIP	Q8WY64	445 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	APBB2	Q92870	758 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOP1MT	Q969P6	601 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	HPDL	Q96IR7	371 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PANX2	Q96RD6	677 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	IPPK	Q9H8X2	491 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	L1RE1	Q9UN81	338 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TFR2	Q9UP52	801 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	6.54	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCHN	A4D1U4	455 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PODXL	O00592	558 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC6	O75061	913 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARN	O95453	639 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TH	P07101	528 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRT19	P08727	400 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLI4	P10075	376 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKCA	P17252	672 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	FPR2	P25090	351 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMO2	P25791	158 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX5	P35711	763 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKCI	P41743	596 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD23B	P54727	409 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIK3	Q13003	919 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	TUSC3	Q13454	348 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF699	Q32M78	642 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		6.53	□□□□□ -1.36
RABGGTB-212	ENST00000491266	WSCD1	Q658N2	575 aa		6.53	□□□□□ -1.36

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