RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 VAMP7P51809 220 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 C21orf59P57076 290 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ZNF394Q53GI3 561 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 KIAA0895Q8NCT3 520 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 GOLGA1Q92805 767 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 NXPE2Q96DL1 559 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 EXOC1Q9NV70 894 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 TK2O00142 265 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PRB1P04280 392 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 HNF1BP35680 557 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ZNF445P59923 1031 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 C6orf118Q5T5N4 469 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ADIPOR2Q86V24 386 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PIGZQ86VD9 579 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 AHI1Q8N157 1196 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 SLC39A7Q92504 469 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 A0A1B0GTQ1 180 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 VILLO15195 856 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 KLRC4O43908 158 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 CDK4P11802 303 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ITPKBP27987 946 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 GCLMP48507 274 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 SLC8A3P57103 927 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 RAB41Q5JT25 222 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ORAI3Q9BRQ5 295 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 SUN2Q9UH99 717 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 GGA2Q9UJY4 613 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ZBED1O96006 694 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 IGHV4-34P06331 123 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 TKTL1P51854 596 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 MBLAC2Q68D91 279 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 GANCQ8TET4 914 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 SKA1Q96BD8 255 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ENC1O14682 589 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 MAPK13O15264 365 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 C1SP09871 688 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 SEMG2Q02383 582 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PPP3CAQ08209 521 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ADGRF1Q5T601 910 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 PM20D1Q6GTS8 502 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 TTC39CQ8N584 583 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 STOML2Q9UJZ1 356 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 AK5Q9Y6K8 562 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 ZNF462Q96JM2 2506 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-210ENST00000491139 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PPC4 97 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 RRP8O43159 456 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 RFPL3O75679 317 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 SLFN14P0C7P3 912 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 TRIM49P0CI25 452 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 TRIM49CP0CI26 452 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 ABCB4P21439 1286 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 RESP18Q5W5W9 173 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 USP30Q70CQ3 517 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 RNF139Q8WU17 664 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NELFE-210ENST00000491139 SLC6A18Q96N87 628 aa21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms