RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.04□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.04□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 DECR2Q9NUI1 292 aa4.04□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.04□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 A0A087WV62 115 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 SLC22A23A1A5C7 686 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 F8W810 466 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 MST1P26927 711 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 CDC25AP30304 524 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 MTAPQ13126 283 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 CNGA3Q16281 694 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 PRTGQ2VWP7 1150 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 BEND5Q7L4P6 421 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 CCDC28AQ8IWP9 274 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 POF1BQ8WVV4 589 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF566Q969W8 418 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 PTPRHQ9HD43 1115 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 RGL1Q9NZL6 768 aa4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
NELFCD-210ENST00000490205 C16orf96A6NNT2 1141 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TTC34A8MYJ7 566 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DHHO43323 396 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CBFA2T3O75081 653 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FGF2P09038 288 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 VPS41P49754 854 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 RAE1P78406 368 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ACOX1Q15067 660 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 RAB30Q15771 203 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SLC44A5Q8NCS7 719 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM41AQ96HV5 264 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZPBPQ9BS86 351 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PCDHAC1Q9H158 963 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SLC39A10Q9ULF5 831 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 VPS4AQ9UN37 437 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 COG5Q9UP83 839 aa4.02□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 AQP12BA6NM10 295 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 LACTBL1A8MY62 500 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PODXLO00592 558 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 NDUFB8O95169 186 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 EPN2O95208 641 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ST6GAL1P15907 406 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 EGR1P18146 543 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TFEBP19484 476 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DUSP1P28562 367 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 IDUAP35475 653 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TRAPPC10P48553 1259 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 KCNJ12Q14500 433 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ERAP2Q6P179 960 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 RFX8Q6ZV50 586 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ADHFE1Q8IWW8 467 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ABHD5Q8WTS1 349 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.778e-7■□□□□ 11.2
NELFCD-210ENST00000490205 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 ZNF112Q9UJU3 913 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.01□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 OR2W5A6NFC9 320 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 F5H423 210 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PCDH17O14917 1159 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 UGDHO60701 494 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TGFB3P10600 412 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 HOXD12P35452 270 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 PBX1P40424 430 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 TECP42680 631 aa4□□□□□ -1.77
NELFCD-210ENST00000490205 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms