RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 ADCY1Q08828 1119 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SCAPQ12770 1279 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MTA1Q13330 715 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TUSC3Q13454 348 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 NAB1Q13506 487 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SPARCL1Q14515 664 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DSC3Q14574 896 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 KCNJ11Q14654 390 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TMED2Q15363 201 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TAF5Q15542 800 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 KCNA10Q16322 511 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 UPP1Q16831 310 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DCAF6Q58WW2 860 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MDH1BQ5I0G3 518 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 RAB41Q5JT25 222 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 C4orf50Q6ZRC1 276 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 Q6ZVU0 165 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CYS1Q717R9 158 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 BNIPLQ7Z465 357 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TRABD2AQ86V40 505 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 OSTM1Q86WC4 334 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DEFB106AQ8N104 65 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PQLC3Q8N755 202 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 GLIS1Q8NBF1 620 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 URGCPQ8TCY9 931 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CKAP2Q8WWK9 683 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MTBPQ96DY7 904 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MAGEB18Q96M61 343 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 GLT1D1Q96MS3 346 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 VAT1Q99536 393 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 B3GNT5Q9BYG0 378 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 USP29Q9HBJ7 922 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 KRT82Q9NSB4 513 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DONSONQ9NYP3 566 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PADI3Q9ULW8 664 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 A0A0A0MRY4 1105 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 M0QYT0 321 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 M0QZQ0 153 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MYO1CO00159 1063 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PSMD3O43242 534 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DGKIO75912 1065 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 KRT37O76014 449 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 B3GAT3O94766 335 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SUN1O94901 812 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CPP00450 1065 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 LTFP02788 710 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PROCP04070 461 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 GSTA1P08263 222 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CTSHP09668 335 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ETS1P14921 441 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 RBL1P28749 1068 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ADRA1BP35368 520 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 GLUD2P49448 558 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SERPINB9P50453 376 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SCNN1GP51170 649 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 CLCNKBP51801 687 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 GDF10P55107 478 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MAP3K7CLP57077 242 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PRKCZQ05513 592 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 DNAJC3Q13217 504 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 SEMA5AQ13591 1074 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ITGA7Q13683 1181 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 LPIN1Q14693 890 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PARP6Q2NL67 630 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 BBS9Q3SYG4 887 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 ARMC3Q5W041 872 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-243ENST00000488923 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms