RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 UBR7Q8N806 425 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 TTC9Q92623 222 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 OTUB2Q96DC9 234 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 NT5C1BQ96P26 610 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 NACA2Q9H009 215 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CYLDQ9NQC7 956 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 TBC1D14Q9P2M4 693 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.75□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 NOTCH2Q04721 2471 aa6.75□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A1W2PQH9 124 aa6.74□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 SYPP08247 313 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 VDRP11473 427 aa6.74□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 HLA-EP13747 358 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 GABRG2P18507 467 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 PGFP49763 221 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 BCAT1P54687 386 aa6.74□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 KCNH2Q12809 1159 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 DHCR24Q15392 516 aa6.74□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SGO2Q562F6 1265 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC157Q569K6 752 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB41Q5JT25 222 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.74□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC186Q7Z3E2 898 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 LMO3Q8TAP4 145 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 UBXN6Q9BZV1 441 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 OSER1Q9NX31 292 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 HESX1Q9UBX0 185 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 RWDD2AQ9UIY3 292 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 NAGPAQ9UK23 515 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 USP3Q9Y6I4 520 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.74□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 LRRK2Q5S007 2527 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ITPR3Q14573 2671 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CBX4O00257 560 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 O00370 1275 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 TBX18O95935 607 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ADH1CP00326 375 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 NTRK1P04629 796 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 PAEPP09466 180 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SETSIPP0DME0 302 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 IRF1P10914 325 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 RALAP11233 206 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ADH5P11766 374 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 RARGP13631 454 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CD19P15391 556 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 HOXD12P35452 270 aa6.73□□□□□ -1.33
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CTDSPL-208ENST00000486978 GCNT1Q02742 428 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 PDE4CQ08493 712 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 BST2Q10589 180 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM270Q6UE05 265 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 HTR3DQ70Z44 454 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 SCD5Q86SK9 330 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 PIGZQ86VD9 579 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 C12orf40Q86WS4 652 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 BBS7Q8IWZ6 715 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF276Q8N554 614 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 MLKLQ8NB16 471 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.73□□□□□ -1.33
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