RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 STIM2Q9P246 746 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MYO6Q9UM54 1294 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HRO43593 1189 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A4P31645 630 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MTA1Q13330 715 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 C2CD6Q53TS8 623 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MPP7Q5T2T1 576 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NADSYN1Q6IA69 706 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 AGPAT1Q99943 283 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 EPC1Q9H2F5 836 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM51Q9NW97 253 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 EBF1Q9UH73 591 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNU1A8MYU2 1149 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 GFRA2O00451 464 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TIMM44O43615 452 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 F9P00740 461 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFAIP3P21580 790 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 WASP42768 502 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NSFP46459 744 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SULT1E1P49888 294 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 GEN1Q17RS7 908 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MS4A13Q5J8X5 152 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 RAP1GAP2Q684P5 730 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ANO7Q6IWH7 933 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM92Q6UXU6 159 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CHSY1Q86X52 802 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 LGI2Q8N0V4 545 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 PGBD3Q8N328 593 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SUMF1Q8NBK3 374 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC30A5Q8TAD4 765 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NCDNQ9UBB6 729 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 F5H5T6 163 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NPC1O15118 1278 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAM23O75077 832 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 RPP40O75818 363 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 UNGP13051 313 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HOXB2P14652 356 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TACR2P21452 398 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MMP8P22894 467 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SGSHP51688 502 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 DEUP1Q05D60 604 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 GAB3Q8WWW8 586 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHB18PQ96TA0 734 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NPY6RQ99463 290 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 C11orf70Q9BRQ4 267 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP58Q9BVL2 599 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 EDEM3Q9BZQ6 932 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CIPCQ9C0C6 399 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 WDCPQ9H6R7 721 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ELOVL2Q9NXB9 296 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAM22Q9P0K1 906 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC53A6NM62 1247 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 NFKBIBQ15653 356 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ASIC2Q16515 512 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 LPAL2Q16609 132 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC25A52Q3SY17 297 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SFMBT2Q5VUG0 894 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CHST9Q7L1S5 443 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 MFN1Q8IWA4 741 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CARNMT1Q8N4J0 409 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 BAP1Q92560 729 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 RUBCNQ92622 972 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ACOX2Q99424 681 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPY26PQ9H489 355 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCB8Q9NUT2 735 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 GMEB2Q9UKD1 530 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HCN2Q9UL51 889 aa19.97■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CALB1P05937 261 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 HLA-FP30511 346 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS24P62847 133 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 CENPCQ03188 943 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 ARCQ7LC44 396 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 RASSF3Q86WH2 238 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP4-209ENST00000484097 AHI1Q8N157 1196 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms