RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470463.1

SND1-208, Transcript of staphylococcal nuclease and tudor domain containing 1, human

TSL 4

Gene SND1, Length 530 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SND1-208	ENST00000470463	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RING1	Q06587	406 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PLD1	Q13393	1074 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	DDR2	Q16832	855 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	SCD5	Q86SK9	330 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	VPS52	Q8N1B4	723 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	OLFM3	Q96PB7	478 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	VAT1	Q99536	393 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463		A0A1W2PQH9	124 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	DCLK1	O15075	740 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	TP73	O15350	636 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RIPK2	O43353	540 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	OPHN1	O60890	802 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	SPAG6	O75602	509 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	ABLIM3	O94929	683 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	AMPD1	P23109	780 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PHB	P35232	272 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	MAGEA6	P43360	314 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	CBX1	P83916	185 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	FPGS	Q05932	587 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RAB33A	Q14088	237 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	HIF1A	Q16665	826 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	NPNT	Q6UXI9	565 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	EXOC4	Q96A65	974 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RWDD3	Q9Y3V2	267 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	INSL6	Q9Y581	213 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.59
SND1-208	ENST00000470463	VWA8	A3KMH1	1905 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463		H3BQF6	201 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	ALOX15B	O15296	676 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	TCEA3	O75764	348 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	SYN1	P17600	705 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	ERCC2	P18074	760 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	RBL1	P28749	1068 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	EPHB2	P29323	1055 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	HOXC13	P31276	330 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	ELF1	P32519	619 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	OR1D2	P34982	312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	ALDH1A3	P47895	512 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	TUB	P50607	506 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	GDF10	P55107	478 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	TAF10	Q12962	218 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	DUSP4	Q13115	394 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	SLC29A2	Q14542	456 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	STAT4	Q14765	748 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	TAF12	Q16514	161 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SND1-208	ENST00000470463	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms