RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 BAP1Q92560 729 aa20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 COX16Q9P0S2 106 aa20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 MYO6Q9UM54 1294 aa20.65■□□□□ 0.9
CTPS1-206ENST00000470271 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CFAP54Q96N23 3096 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 GOLGA8SH3BPF8 625 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 M0QYT0 321 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 AXIN1O15169 862 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 TBL1XO60907 577 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 UNGP13051 313 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 MMP8P22894 467 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NTSR1P30989 418 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CCR1P32246 355 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NME3Q13232 169 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CHPFQ8IZ52 775 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SLC30A5Q8TAD4 765 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RNF34Q969K3 372 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa20.64■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ALDH1A2O94788 518 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ABCB4P21439 1286 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SDE2Q6IQ49 451 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ANO7Q6IWH7 933 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 GAB3Q8WWW8 586 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ACOX2Q99424 681 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NPY6RQ99463 290 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 AGPAT1Q99943 283 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RAB23Q9ULC3 237 aa20.63■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 HOXB2P14652 356 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 HLA-FP30511 346 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 WASP42768 502 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NSFP46459 744 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SULT1E1P49888 294 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 UBASH3AP57075 661 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CENPCQ03188 943 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 MTA1Q13330 715 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RNF43Q68DV7 783 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RASSF3Q86WH2 238 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CHSY1Q86X52 802 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 UCMAQ8WVF2 138 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NT5C3BQ969T7 300 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 MYEOVQ96EZ4 313 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 C11orf70Q9BRQ4 267 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 STIM2Q9P246 746 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM59LQ9UK28 342 aa20.62■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 LRRC53A6NM62 1247 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NPC1O15118 1278 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 TIMM44O43615 452 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 TACR2P21452 398 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 FLT3P36888 993 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 E2F5Q15329 346 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 NFKBIBQ15653 356 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 SLC25A52Q3SY17 297 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CEP68Q76N32 757 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ARCQ7LC44 396 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 LGI2Q8N0V4 545 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 RUBCNQ92622 972 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 GABRG3Q99928 467 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 EDEM3Q9BZQ6 932 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CIPCQ9C0C6 399 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM51Q9NW97 253 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 ADAM22Q9P0K1 906 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 EML5Q05BV3 1969 aa20.61■□□□□ 0.89
CTPS1-206ENST00000470271 F5H5T6 163 aa20.6■□□□□ 0.89
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