RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466247.1

RBM6-215, Transcript of RNA binding motif protein 6, human

TSL 2

Gene RBM6, Length 500 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM6-215	ENST00000466247	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	USP12	O75317	370 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PLAU	P00749	431 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	CD63	P08962	238 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PRF1	P14222	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	MATN1	P21941	496 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	STAT6	P42226	847 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	STIM1	Q13586	685 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	NRAC	Q8N912	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RBM6-215	ENST00000466247	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	KAT7	O95251	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ST6GAL1	P15907	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	HOXD12	P35452	270 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CPA2	P48052	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MTA1	Q13330	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TWIST1	Q15672	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	BTBD16	Q32M84	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PIGK	Q92643	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GPR78	Q96P69	363 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RAB21	Q9UL25	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	LOC105369274	A0A096LPK9	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	LOC102723532	A0A0G2JNH3	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM38	O00635	465 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SLC8A1	P32418	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF84	P51523	738 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM14	Q14142	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	AAK1	Q2M2I8	961 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZACN	Q401N2	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	P2RY11	Q96G91	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MECR	Q9BV79	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MYMK	A6NI61	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PPP6R2	O75170	966 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ITGB6	P18564	788 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	MAPK7	Q13164	816 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	CBFB	Q13951	182 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RBM6-215	ENST00000466247	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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