RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 COX16Q9P0S2 106 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 EBF1Q9UH73 591 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 CKAP5Q14008 2032 aa15.31■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ANTXRLA6NF34 631 aa15.3■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 GOLGA8SH3BPF8 625 aa15.3■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 PRR23BQ6ZRT6 265 aa15.3■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP15.3■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 DOCK4Q8N1I0 1966 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 MYO15AQ9UKN7 3530 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM170AA1A519 330 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNU1A8MYU2 1149 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP15.29■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 ABCA7Q8IZY2 2146 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 NUP205Q92621 2012 aa15.29■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 F5H5T6 163 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 HRO43593 1189 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 CENPCQ03188 943 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 RASSF3Q86WH2 238 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 LGI2Q8N0V4 545 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 AHI1Q8N157 1196 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC30A5Q8TAD4 765 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 BAP1Q92560 729 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.28■□□□□ 0.04
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SH3BP1-205ENST00000466097 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.28■□□□□ 0.04
SH3BP1-205ENST00000466097 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
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