RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	CDK7	P50613	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NHLH1	Q02575	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	IQCB1	Q15051	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ATP2A3	Q93084	1043 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RADIL	Q96JH8	1075 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SYNC	Q9H7C4	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006		E9PLN8	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RGS10	O43665	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SUN1	O94901	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MLYCD	O95822	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	F9	P00740	461 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CLEC3B	P05452	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CPA1	P15085	419 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FOLR3	P41439	243 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	KRT83	P78385	493 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CSHL1	Q14406	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SEC23B	Q15437	767 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CUL5	Q93034	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	DHH	O43323	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PEX1	O43933	1283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	VPS4B	O75351	444 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TAF5L	O75529	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TSPAN9	O75954	239 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	APOA4	P06727	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LAMP2	P13473	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	GATA3	P23771	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LRPAP1	P30533	357 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	UBA7	P41226	1012 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	MC2R	Q01718	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PDCL	Q13371	301 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	BECN1	Q14457	450 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	LPIN2	Q92539	896 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	STAM	Q92783	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CNOT10-208	ENST00000463006	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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