RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 TRIM4Q9C037 500 aa25.31■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 BIRC5O15392 142 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 UGT1A9O60656 530 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 BPGMP07738 259 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGAP8P85298 464 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CDC42EP1Q00587 391 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CDO1Q16878 200 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 TMCO4Q5TGY1 634 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 NOTUMQ6P988 496 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CCNJLQ8IV13 435 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 RILPQ96NA2 401 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 RNF157Q96PX1 679 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 C20orf27Q9GZN8 174 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 UGT1A7Q9HAW7 530 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 UGT1A10Q9HAW8 530 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 UGT1A8Q9HAW9 530 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 DOCK3Q8IZD9 2030 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 NRCAMQ92823 1304 aa25.3■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CRHR1P34998 444 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 POLE2P56282 527 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 GLRA4Q5JXX5 417 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC39Q96DD0 335 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 TTC1Q99614 292 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 KLC2Q9H0B6 622 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 FAM49BQ9NUQ9 324 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 PCMTD2Q9NV79 361 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 FKBP6O75344 327 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 F2P00734 622 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CSH1P0DML2 217 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CSH2P0DML3 217 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 MAGEA6P43360 314 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC14Q49A88 953 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 FAXCQ5TGI0 409 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 BEST2Q8NFU1 509 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 RNF19AQ9NV58 838 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.29■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SDR42E2A6NKP2 422 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 PRPSAP2O60256 369 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 DARSP14868 501 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 BIRC2Q13490 618 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ARCQ7LC44 396 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 NDUFAF2Q8N183 169 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC52Q8N7C0 313 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC28BQ9BUN5 200 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SLC4A5Q9BY07 1137 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 AP1G2O75843 785 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 BAG2O95816 211 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CYP2C9P11712 490 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 AOC1P19801 751 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 STX3Q13277 289 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 UNC5AQ6ZN44 842 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 PLD5Q8N7P1 536 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SLC35F5Q8WV83 523 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 THAP1Q9NVV9 213 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 PPM1HQ9ULR3 514 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SOX13Q9UN79 622 aa25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 APRTP07741 180 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 RBL1P28749 1068 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CPOXP36551 454 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ERFP50548 548 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 CDC16Q13042 620 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM110Q86TL2 294 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SESTD1Q86VW0 696 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 STKLD1Q8NE28 680 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 EBF4Q9BQW3 602 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 GJD2Q9UKL4 321 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 RECQL4O94761 1208 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ZBED1O96006 694 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SETSIPP0DME0 302 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SLC6A3Q01959 620 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 HIC1Q14526 733 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SOWAHAQ2M3V2 549 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 AAGABQ6PD74 315 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 MCUQ8NE86 351 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 SIKE1Q9BRV8 207 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 ETAA1Q9NY74 926 aa25.27■■□□□ 1.64
FAAP20-206ENST00000414253 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 A0A088AWK7 358 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 HMX2A2RU54 273 aa25.26■■□□□ 1.63
FAAP20-206ENST00000414253 FAM159BA6NKW6 160 aa25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms