RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCOA4Q13772 614 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SEZ6Q53EL9 994 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C6orf118Q5T5N4 469 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TXNDC8Q6A555 127 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITIH5Q86UX2 942 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF677Q86XU0 584 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UBR7Q8N806 425 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APPL2Q8NEU8 664 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAF4BQ92750 862 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOX5Q96PH1 765 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADPGKQ9BRR6 497 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ISCUQ9H1K1 167 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAREM1Q9H706 876 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPNE5Q9HCH3 593 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDC23Q9UJX2 597 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.01□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTMR11A4FU01 709 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CILPO75339 1184 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H2AFZP0C0S5 128 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HARSP12081 509 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JUPP14923 745 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CHRNB2P17787 502 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFAIP3P21580 790 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFNAR2P48551 515 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BPIFB4P59827 614 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MESP2Q0VG99 397 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GPR17Q13304 367 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CUL2Q13617 745 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EML3Q32P44 896 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C4orf17Q53FE4 359 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H2AFVQ71UI9 128 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFCAB13Q8IY85 973 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM130Q8N3G9 435 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEP120Q8N960 986 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXorf38Q8TB03 319 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GIPC2Q8TF65 315 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSCP1Q8WVF1 389 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGF11Q92914 225 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP2A3Q93084 1043 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MED8Q96G25 268 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ACAP3Q96P50 834 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSPAN18Q96SJ8 248 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XYLT2Q9H1B5 865 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00597Q9H2U6 94 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 VRTNQ9H8Y1 702 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KIF9Q9HAQ2 790 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DERAQ9Y315 318 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2CD2Q9Y426 696 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 JRKLQ9Y4A0 524 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIP11Q15643 1979 aa10□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD62A6NC57 917 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ENO4A6NNW6 628 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LACTBL1A8MY62 500 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FLRT2O43155 660 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP26A1O43174 497 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFSF14O43557 240 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADAM23O75077 832 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHACTR2O75167 634 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MOCS3O95396 460 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STAU1O95793 577 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CST3P01034 146 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNNC2P02585 160 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM253P0C7T8 217 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CXCL8P10145 99 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP11B1P15538 503 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNSP15586 552 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATICP31939 592 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF132P52740 706 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OSTNP61366 133 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FMO1Q01740 532 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CDR2Q01850 454 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NR1H3Q13133 447 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAF12Q16514 161 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PTPRNQ16849 979 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.99□□□□□ -0.81
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC10A6Q3KNW5 377 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms