RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PIK3R6Q5UE93 754 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RAP1GAP2Q684P5 730 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MYEOVQ96EZ4 313 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MCEEQ96PE7 176 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ISCUQ9H1K1 167 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CLEC4EQ9ULY5 219 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 K7EQS6 105 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RNF40O75150 1001 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 F9P00740 461 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB6CQ53S08 254 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 GRAMD4Q6IC98 578 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 BNIPLQ7Z465 357 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CNGA4Q8IV77 575 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 WDCPQ9H6R7 721 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ANLNQ9NQW6 1124 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ADCY5O95622 1261 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 GRIA2P42262 883 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DGKGP49619 791 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SEC13P55735 322 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MAMLD1Q13495 774 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CHSY1Q86X52 802 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SYNPOQ8N3V7 929 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF653Q96CK0 615 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TKTL2Q9H0I9 626 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PARVAQ9NVD7 372 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TBC1D3BA6NDS4 549 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TBL1XO60907 577 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CISD3P0C7P0 127 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 COL9A1P20849 921 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TACR2P21452 398 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 GPD1P21695 349 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO43Q4G163 708 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MS4A13Q5J8X5 152 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PKN3Q6P5Z2 889 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DCUN1D2Q6PH85 259 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 C1orf210Q8IVY1 113 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 LGI2Q8N0V4 545 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CHP1Q99653 195 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO10Q9UK96 956 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa24.71■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 I6L893 689 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 PAGE1O75459 146 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 GGCXP38435 758 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 PTPN9P43378 593 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 NUBP1P53384 320 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 BRMS1LQ5PSV4 323 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM131BQ86XD5 332 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP52Q8N1V2 620 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 TERB1Q8NA31 727 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 PRSS33Q8NF86 280 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 STIM2Q9P246 746 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 MYO1AQ9UBC5 1043 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A0A0MRY4 1105 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKRD62A6NC57 917 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 ENDOD1O94919 500 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC122Q5T0U0 273 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 TC2NQ8N9U0 490 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM172AQ8WUF8 416 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 DEF6Q9H4E7 631 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 HS3ST4Q9Y661 456 aa24.69■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 F5H5T6 163 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 C2orf27AQ580R0 203 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 EMC10Q5UCC4 262 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM11Q96F44 468 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 SIK2Q9H0K1 926 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.68■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.67■■□□□ 1.54
UBE2E3-202ENST00000410062 CCP110O43303 1012 aa24.67■■□□□ 1.54
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