RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 PROSER3Q2NL68 480 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 BOLA3Q53S33 107 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 GNASQ5JWF2 1037 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 CNTD1Q8N815 330 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ZFP28Q8NHY6 868 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 CLIC6Q96NY7 704 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 VAT1Q99536 393 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PHTF1Q9UMS5 762 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SNX9Q9Y5X1 595 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SH3PXD2BA1X283 911 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 JAK2O60674 1132 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 TRAPPC2P0DI81 140 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 TRAPPC2BP0DI82 140 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PPIBP23284 216 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 CBX3Q13185 183 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 TTC23LQ6PF05 361 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 XXYLT1Q8NBI6 393 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SUN5Q8TC36 379 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 TSPEARQ8WU66 669 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 E2F7Q96AV8 911 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PHF20Q9BVI0 1012 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 BARHL2Q9NY43 387 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 TBC1D14Q9P2M4 693 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 VPS28Q9UK41 221 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PTPRJQ12913 1337 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 K7ERI5 159 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SGK1O00141 431 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 RGS7P49802 495 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 CPT1AP50416 773 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 AIF1P55008 147 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 GLB1LQ6UWU2 654 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 PGAP1Q75T13 922 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 GDPD5Q8WTR4 605 aa5□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 SP140LQ9H930 580 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ASB4Q9Y574 426 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ABCA1O95477 2261 aa5□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 HEATR9A2RTY3 570 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 CYP27B1O15528 508 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 USP1O94782 785 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 GPIP06744 558 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 RAG1P15918 1043 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ALDH9A1P49189 494 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 COQ5Q5HYK3 327 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ART4Q93070 314 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ASIC4Q96FT7 647 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SIAEQ9HAT2 523 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 SLIT2O94813 1529 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 M6PRP20645 277 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 SBK1Q52WX2 424 aa4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 HPRP00739 348 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 FASP25445 335 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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PTPRD-203ENST00000381196 TGFB2P61812 414 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 ITGADQ13349 1161 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRD-203ENST00000381196 GALNT13Q8IUC8 556 aa4.99□□□□□ -1.61
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