RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 TIMP1P01033 207 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 VAV1P15498 845 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 CCR1P32246 355 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 MAGEA6P43360 314 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 MSANTD2Q6P1R3 559 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 FBXO22Q8NEZ5 403 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 SERPINB12Q96P63 405 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 GMIPQ9P107 970 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 MTRRQ9UBK8 725 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 SNX10Q9Y5X0 201 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 CDY1Q9Y6F8 540 aa25.09■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 COL4A6Q14031 1691 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 LRIG2O94898 1065 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 YWHAQP27348 245 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 SLCO1A2P46721 670 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 GLUD2P49448 558 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 PPP2R5DQ14738 602 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 LONRF1Q17RB8 773 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 FAM182AQ5T1J6 154 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 PDIK1LQ8N165 341 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 GPR152Q8TDT2 470 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 SERPINB11Q96P15 392 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SERF1B-201ENST00000380750 PLXNA3P51805 1871 aa25.08■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 MSI1O43347 362 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ITGB8P26012 769 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 AUHQ13825 339 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 STAT4Q14765 748 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 SKIDA1Q1XH10 827 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 MSS51Q4VC12 460 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC13Q8IYE1 715 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 FERMT1Q9BQL6 677 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC77Q9BR77 488 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 PRDM12Q9H4Q4 367 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 COMMD8Q9NX08 183 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 NUDT5Q9UKK9 219 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 BACE2Q9Y5Z0 518 aa25.07■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 AGTP01019 485 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 EPHB2P29323 1055 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ATP1A2P50993 1020 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 DUSP4Q13115 394 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 NETO2Q8NC67 525 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 FBXO32Q969P5 355 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 MYO16Q9Y6X6 1858 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 A0A0A0MRY4 1105 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 BANF1O75531 89 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 IVLP07476 585 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CSF2RAP15509 400 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 AP1B1Q10567 949 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CBLBQ13191 982 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 PSMD5Q16401 504 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 VPS52Q8N1B4 723 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 P2RY11Q96G91 374 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 SPATA13Q96N96 652 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 LTBP2Q14767 1821 aa25.06■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 WDR27A2RRH5 827 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 KIAA0355O15063 1070 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 NCAM2O15394 837 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ADAM12O43184 909 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 PAGE1O75459 146 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 METTL18O95568 372 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 DEFB103AP81534 67 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 FAXCQ5TGI0 409 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CCNYQ8ND76 341 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 PYROXD1Q8WU10 500 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 CAPS2Q9BXY5 557 aa25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 KCNU1A8MYU2 1149 aa25.04■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 STK10O94804 968 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 HTR7P34969 479 aa25.04■■□□□ 1.6
SERF1B-201ENST00000380750 SERPINB6P35237 376 aa25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms