RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 HMGB4Q8WW32 186 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GOLGA1Q92805 767 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 C3orf49Q96BT1 292 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM167BQ9BTA0 163 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 VPS16Q9H269 839 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ASIC5Q9NY37 505 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR17Q8IZU2 1322 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3EA0A087X179 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SEPT4O43236 478 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 DNPH1O43598 174 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 BCAR3O75815 825 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 BMP15O95972 392 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MT-CO3P00414 261 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SERPINA4P29622 427 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MCM5P33992 734 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GRK5P34947 590 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 THBS4P35443 961 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PCP4P48539 62 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CFHR3Q02985 330 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MAPK7Q13164 816 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 RABEP1Q15276 862 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TAF12Q16514 161 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM187BQ17R55 369 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TIGD6Q17RP2 521 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 BTBD16Q32M84 506 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TANGO2Q6ICL3 276 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GLMPQ8WWB7 406 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 THAP4Q8WY91 577 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SUFUQ9UMX1 484 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa3.3□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 E5RJQ4 531 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CTIFO43310 598 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 CA12O43570 354 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PPP6R2O75170 966 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NTN1O95631 604 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 HSD3B1P14060 373 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 KLRK1P26718 216 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TACR3P29371 465 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GALNSP34059 522 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NR4A2P43354 598 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MMP13P45452 471 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 WDR5P61964 334 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TLE3Q04726 772 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MTAPQ13126 283 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 DNASE1L3Q13609 305 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 AWAT1Q58HT5 328 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 FAM90A2PQ658T7 463 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 ANO7Q6IWH7 933 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 UEVLDQ8IX04 471 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 MYRIPQ8NFW9 859 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 SENP7Q9BQF6 1050 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD3E-201ENST00000362899 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms