RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TTPALQ9BTX7 342 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TMEM60Q9H2L4 133 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SP140LQ9H930 580 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GDAQ9Y2T3 454 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 USP34Q70CQ2 3546 aa7.47□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 A6NL46 340 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PSMG1O95456 288 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PRLP01236 227 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SMIM18P0DKX4 95 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 HOXC8P31273 242 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 RPL9P32969 192 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 MAN1A1P33908 653 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 STT3AP46977 705 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 RASSF2P50749 326 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 STAT5BP51692 787 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 CLCN3P51790 818 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PEX3P56589 373 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GNG2P59768 71 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 GPR141Q7Z602 305 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ZNF507Q8TCN5 953 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 CCDC138Q96M89 665 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 IFT22Q9H7X7 185 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 HCSTQ9UBK5 93 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 STK17AQ9UEE5 414 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.46□□□□□ -1.21
CCR6-202ENST00000349984 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ARID2Q68CP9 1835 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SCO2O43819 266 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SIN3BO75182 1162 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 RHOBTB3O94955 611 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PGM3O95394 542 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SELPP16109 830 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PTPN9P43378 593 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 BPIFB3P59826 476 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 NADK2Q4G0N4 442 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 NT5DC4Q86YG4 428 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 BORCS5Q969J3 196 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 OLFM1Q99784 485 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PRDM12Q9H4Q4 367 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ZNF302Q9NR11 478 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 MTMR10Q9NXD2 777 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 RRN3Q9NYV6 651 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 AK5Q9Y6K8 562 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 STK36Q9NRP7 1315 aa7.46□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 POTEB3A0JP26 581 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GOLGA8RI6L899 631 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GAS7O60861 476 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PSMD10O75832 226 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 CA3P07451 260 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 HADHAP40939 763 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 GATMP50440 423 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 DNM2P50570 870 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 XRRA1Q6P2D8 792 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 POTEBQ6S5H4 581 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 KSR1Q8IVT5 923 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SLC5A5Q92911 643 aa7.45□□□□□ -1.22
CCR6-202ENST00000349984 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms