RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 TP53INP2Q8IXH6 220 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 INPP5DQ92835 1189 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SYT15Q9BQS2 421 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MED10Q9BTT4 135 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 HAO1Q9UJM8 370 aa21.39■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 C9IYK1 514 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CBX6O95503 412 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 AMHP03971 560 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CACNA2D1P54289 1103 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 GJA9P57773 515 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PDK1Q15118 436 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PARP6Q2NL67 630 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CST9Q5W186 159 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 C17orf99Q6UX52 265 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RFX8Q6ZV50 586 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 AGAP11Q8TF27 550 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 NTAN1Q96AB6 310 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM105AQ9NUU6 356 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 WDR27A2RRH5 827 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CREB3O43889 395 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMB4P28070 264 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RGS2P41220 211 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SERPINB9P50453 376 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SCAPQ12770 1279 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 NME3Q13232 169 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 GPR162Q16538 588 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB41Q5JT25 222 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CES4AQ5XG92 561 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TIFABQ6ZNK6 161 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 UNC5BQ8IZJ1 945 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC9A7Q96T83 725 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CEP41Q9BYV8 373 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MIOSQ9NXC5 875 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPV2Q9Y5S1 764 aa21.38■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 E7ENQ6 273 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM72CH0Y354 149 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXO21O94952 628 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 DLDP09622 509 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SARNPP82979 210 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 AP1B1Q10567 949 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 FAM72BQ86X60 149 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF567Q8N184 647 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SKA1Q96BD8 255 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PCED1BQ96HM7 432 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 GAD1Q99259 594 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MECRQ9BV79 373 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 HHLA1C9JL84 531 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ADRA1BP35368 520 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CLCNKBP51801 687 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CRADDP78560 199 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM86AQ8N2M4 240 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TRPV1Q8NER1 839 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PCMTD2Q9NV79 361 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 IGSF9Q9P2J2 1179 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa21.37■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A0G2JND7 137 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 AP1G2O75843 785 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 AIF1P55008 147 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TEX44Q53QW1 395 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MROH9Q5TGP6 573 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC7A14Q8TBB6 771 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 LPPQ93052 612 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 GORASP1Q9BQQ3 440 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SAR1AQ9NR31 198 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC17A6Q9P2U8 582 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 SDR42E2A6NKP2 422 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 MGAT1P26572 445 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 LHX1P48742 406 aa21.36■■□□□ 1.01
KCNQ1-202ENST00000335475 E2F5Q15329 346 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms