RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332345.10

LIMS1-201, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-201ENST00000332345 KRT3P12035 628 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 HOXA6P31267 233 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 TIE1P35590 1138 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 SULT1E1P49888 294 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 DEUP1Q05D60 604 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 TSSK4Q6SA08 328 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 CAMKK1Q8N5S9 505 aa14.53□□□□□ -0.08
LIMS1-201ENST00000332345 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.53□□□□□ -0.08
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LIMS1-201ENST00000332345 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa14.53□□□□□ -0.08
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LIMS1-201ENST00000332345 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 NTSR1P30989 418 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 CASP14P31944 242 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 DGKEP52429 567 aa14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 RPS24P62847 133 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LIMS1-201ENST00000332345 GEN1Q17RS7 908 aa14.5□□□□□ -0.09
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