RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 LPIN1Q14693 890 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ARL13BQ3SXY8 428 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 APOPT1Q96IL0 206 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ADAM2Q99965 735 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PRDM12Q9H4Q4 367 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DDIT4Q9NX09 232 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GGT7Q9UJ14 662 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 DSEQ9UL01 958 aa22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 UBOX5O94941 541 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 F9P00740 461 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CYP11A1P05108 521 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ALADP13716 330 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GRIA1P42261 906 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM171BQ6P995 826 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 MPP5Q8N3R9 675 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 VPS11Q9H270 941 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.41■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PAX3P23760 479 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 BRCC3P46736 316 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 HCAR3P49019 387 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TPI1P60174 286 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SEMA3BQ13214 749 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TUSC3Q13454 348 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 NETO2Q8NC67 525 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 IRGQQ8WZA9 623 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 NOD1Q9Y239 953 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RAD54BQ9Y620 910 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM72CH0Y354 149 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RASSF9O75901 435 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM155BO75949 473 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PYGBP11216 843 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SKIP12755 728 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ERCC2P18074 760 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 NEK3P51956 506 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PARP6Q2NL67 630 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 GALNTL6Q49A17 601 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 LRRC8BQ6P9F7 803 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM72BQ86X60 149 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 APBB2Q92870 758 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 RMDN2Q96LZ7 410 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 UROC1Q96N76 676 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 COLEC11Q9BWP8 271 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 SMYD2Q9NRG4 433 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.4■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 M0QZQ0 153 aa22.39■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 BDNFP23560 247 aa22.39■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.39■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 ANLNQ9NQW6 1124 aa22.39■■□□□ 1.18
SPHK1-201ENST00000323374 FAM159BA6NKW6 160 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 F5H423 210 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ALDH1A1P00352 501 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MGAT5Q09328 741 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 WASHC5Q12768 1159 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CYS1Q717R9 158 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 FITM2Q8N6M3 262 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 EDEM1Q92611 657 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 WDCPQ9H6R7 721 aa22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 WDR91A4D1P6 747 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 I6L893 689 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 KRT38O76015 456 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF567Q8N184 647 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF276Q8N554 614 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 HASPINQ8TF76 798 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 MTBPQ96DY7 904 aa22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 NCAM2O15394 837 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 PSMB4P28070 264 aa22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms