RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317623.8

PCNX4-201, Transcript of pecanex 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene PCNX4, Length 17,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-201ENST00000317623 USP17L22D6RA61 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 USP17L19D6RCP7 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 USP17L20D6RJB6 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 HPCAP84074 193 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 USP17L24Q0WX57 530 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PJA1Q8NG27 643 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 VPS4AQ9UN37 437 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SSR3Q9UNL2 185 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ABCB11O95342 1321 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 MAGEB2O15479 319 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SOAT1P35610 550 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 MTMR8Q96EF0 704 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 LXNQ9BS40 222 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 TIPINQ9BVW5 301 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PZPP20742 1482 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 HIST1H2ADP20671 130 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ITGA3P26006 1051 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PLET1Q6UQ28 207 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 UCMAQ8WVF2 138 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 MYLPFQ96A32 169 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 YEATS2Q9ULM3 1422 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 A2MP01023 1474 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SUPT7LO94864 414 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 RARBP10826 455 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 TTC23LQ6PF05 361 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 KRT78Q8N1N4 520 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 CPNE1Q99829 537 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SIK2Q9H0K1 926 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 MYH8P13535 1937 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 DHRS12A0PJE2 317 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ORC5O43913 435 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 GRIK3Q13003 919 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.75□□□□□ -1.33
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PCNX4-201ENST00000317623 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 UPP2O95045 317 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 OR2B6P58173 313 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 TRPV1Q8NER1 839 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 RTKNQ9BST9 563 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 KCND2Q9NZV8 630 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 OR14I1A6ND48 311 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 GZMAP12544 262 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 BTBD9Q96Q07 612 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 GTF3C4Q9UKN8 822 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 H6PDO95479 791 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 GLRBP48167 497 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 CLCN2P51788 898 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 CCNG1P51959 295 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF235Q14590 738 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 POGZQ7Z3K3 1410 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 THRBP10828 461 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ATF6P18850 670 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PTPAQ15257 358 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.75□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 GRAP2O75791 330 aa6.74□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 MYL4P12829 197 aa6.74□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 IFI30P13284 250 aa6.74□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PDK4Q16654 411 aa6.74□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.74□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PCNX4-201ENST00000317623 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.74□□□□□ -1.33
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