RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD3Q8N6K7 520 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC18Q9H819 358 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS28Q9UK41 221 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TSPAN16Q9UKR8 245 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 NPY2RP49146 381 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF284Q2VY69 593 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 FUKQ8N0W3 1084 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 ELMO3Q96BJ8 720 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 TBCBQ99426 244 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 DSEQ9UL01 958 aa24.7■■□□□ 1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 C21orf59P57076 290 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPK11Q15759 364 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIQKQ629K1 86 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO39Q8N4B4 442 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF145Q96MT1 663 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PNMA5Q96PV4 448 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 APOL4Q9BPW4 351 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MICAL2O94851 1124 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PIPSLA2A3N6 862 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ADRA1DP25100 572 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 VN1R5Q7Z5H4 357 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RORBQ92753 470 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RNFT2Q96EX2 444 aa24.7■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MED26O95402 600 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FEN1P39748 380 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PDZK1Q5T2W1 519 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DPP10Q8N608 796 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SPPL2AQ8TCT8 520 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf16Q9BUW7 83 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NMRAL1Q9HBL8 299 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DCXO43602 365 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT6AP02538 564 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT6BP04259 564 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT6CP48668 564 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT2B28Q9BY64 529 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 POMKQ9H5K3 350 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NR2C2P49116 596 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MEA1Q16626 185 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 DGUOKQ16854 277 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SETD9Q8NE22 299 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 LPCAT1Q8NF37 534 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FLCNQ8NFG4 579 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD49Q8WVL7 239 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC39Q96DD0 335 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MIEF1Q9NQG6 463 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.69■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ETS1P14921 441 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SAMD7Q7Z3H4 446 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM192AQ9GZU8 254 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNK4Q9NYG8 393 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX8Q9Y5X2 465 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CBX4O00257 560 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NAB1Q13506 487 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CES3Q6UWW8 571 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TLK2Q86UE8 772 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RIBC2Q9H4K1 309 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 TPRKBQ9Y3C4 175 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CDK7P50613 346 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A087X0B3 334 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 PROCP04070 461 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 SCNN1BP51168 640 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 NDST1P52848 882 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 STK32CQ86UX6 486 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 MARC1Q5VT66 337 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 CEP44Q9C0F1 390 aa24.68■■□□□ 1.54
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS4BO75351 444 aa24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms