RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELNP15502 786 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 GJA9P57773 515 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DPYSL2Q16555 572 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 VPS52Q8N1B4 723 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR91A4D1P6 747 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP69A5D8W1 941 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMAPO00193 183 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERPINB4P48594 390 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC25A52Q3SY17 297 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCNJLQ8IV13 435 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PADI3Q9ULW8 664 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR182O15218 404 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 USP17L7P0C7H9 530 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYBAP13498 195 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 AP1B1Q10567 949 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CKAP2Q8WWK9 683 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PCED1BQ96HM7 432 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 LGMNQ99538 433 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNA10Q16322 511 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 GGA2Q9UJY4 613 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 INHBAP08476 426 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCAM1P13591 858 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 YY1P25490 414 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 EDEM1Q92611 657 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYTH2Q99418 400 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 EURLQ9NYK6 297 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUPT3HO75486 399 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNJ11Q14654 390 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPM1NQ8N819 430 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TSPAN18Q96SJ8 248 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACSS3Q9H6R3 686 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 NRP1O14786 923 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRCC3P46736 316 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 EFHC2Q5JST6 749 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CASC4Q6P4E1 433 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 STRADAQ7RTN6 431 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CHADO15335 359 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CA12O43570 354 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 METTL18O95568 372 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 NOS2P35228 1153 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 LHX1P48742 406 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 WDR4P57081 412 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJC3Q13217 504 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM35AQ86V20 835 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 DTLQ9NZJ0 730 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 E7ENQ6 273 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SEPT4O43236 478 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SP100P23497 879 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPARCL1Q14515 664 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SERINC5Q86VE9 423 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TDRPQ86YL5 185 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAM2Q99965 735 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 HOXC8P31273 242 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ERFP50548 548 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPOCK2Q92563 424 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 CYLDQ9NQC7 956 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 HTTP42858 3142 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 E7ESA3 106 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNF139Q8WU17 664 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNF34Q969K3 372 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 PIGVQ9NUD9 493 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF236Q9UL36 1845 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms