RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 PARP6Q2NL67 630 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 GPC2Q8N158 579 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 STK32AQ8WU08 396 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 HSFY1Q96LI6 401 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 VAPBO95292 243 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 VGLL4Q14135 290 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DDI1Q8WTU0 396 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 H7C4K7 107 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 UNC5CO95185 931 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC130P13994 396 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MMP13P45452 471 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 RAB42Q8N4Z0 105 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PWWP2AQ96N64 755 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0A0MRY4 1105 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 LTFP02788 710 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PSMC3P17980 439 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FLT3P36888 993 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 SREBF2Q12772 1141 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 WNT8BQ93098 351 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM169Q96HH4 297 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 SPATA13Q96N96 652 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ACSS3Q9H6R3 686 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 VTI1BQ9UEU0 232 aa18.04■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 USP12O75317 370 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DMC1Q14565 340 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 RNF43Q68DV7 783 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NPNTQ6UXI9 565 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 COPS5Q92905 334 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 VPS50Q96JG6 964 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MYPNQ86TC9 1320 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 POMCP01189 267 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 SERPINF2P08697 491 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF280DQ6N043 979 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 HS6ST3Q8IZP7 471 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 BHMTQ93088 406 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 C5orf58C9J3I9 102 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ADM5C9JUS6 153 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 C2CD2LO14523 706 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ALOX15BO15296 676 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CRABP2P29373 138 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PEAK1Q9H792 1746 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MFSD10Q14728 455 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 IQSEC1Q6DN90 963 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF470Q6ECI4 717 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF384Q8TF68 577 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PHF21BQ96EK2 531 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 APBA2Q99767 749 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NMRAL1Q9HBL8 299 aa18.03■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TUBP50607 506 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DAB2P98082 770 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FUT11Q495W5 492 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF786Q8N393 782 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FAM84AQ96KN4 292 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 MT-CO1P00395 513 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 RAB27AP51159 221 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NME5P56597 212 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 NFYCQ13952 458 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ADRM1Q16186 407 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF398Q8TD17 642 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO44Q9H4M3 255 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.02■□□□□ 0.48
SCARB2-201ENST00000264896 DCXO43602 365 aa18.02■□□□□ 0.47
SCARB2-201ENST00000264896 RAMP2O60895 175 aa18.02■□□□□ 0.47
SCARB2-201ENST00000264896 MMP8P22894 467 aa18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms