RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 JADE3Q92613 823 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HOXC10Q9NYD6 342 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 POMPQ9Y244 141 aa15.37■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 F5H423 210 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ITGAXP20702 1163 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DLG1Q12959 904 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PEX6Q13608 980 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DCAF15Q66K64 600 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SAMD7Q7Z3H4 446 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HIPK4Q8NE63 616 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 VCX3BQ9H321 246 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PSAT1Q9Y617 370 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SOWAHBA6NEL2 793 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 P4HA1P13674 534 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 VCLP18206 1134 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 EDNRBP24530 442 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 XIAPP98170 497 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GRM2Q14416 872 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CASC4Q6P4E1 433 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HPS6Q86YV9 775 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 OLFM3Q96PB7 478 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TMEM216Q9P0N5 145 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa15.36■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 LOC100653049A0A140TA62 436 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ZNF487B1APH4 448 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ADCY6O43306 1168 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 OPHN1O60890 802 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 KRT34O76011 436 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MYL4P12829 197 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 YY1P25490 414 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GMPRP36959 345 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SLC6A3Q01959 620 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 STILQ15468 1287 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HSDL1Q3SXM5 330 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PPM1JQ5JR12 505 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 FRMD7Q6ZUT3 714 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SCUBE3Q8IX30 993 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PHTF2Q8N3S3 785 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ATP2A3Q93084 1043 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CMTM5Q96DZ9 223 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HAPLN3Q96S86 360 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HESX1Q9UBX0 185 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ARIH2O95376 493 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ITGA2BP08514 1039 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 VAV1P15498 845 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 RAG1P15918 1043 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GRK2P25098 689 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CLCN3P51790 818 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DPYSL2Q16555 572 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TTC30AQ86WT1 665 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 FBXW8Q8N3Y1 598 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CDKL2Q92772 493 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GPR20Q99678 358 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NT5C1AQ9BXI3 368 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 FAM96AQ9H5X1 160 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 COPG2Q9UBF2 871 aa15.35■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 H3BNX3 289 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NFKBIEO00221 500 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ZMPSTE24O75844 475 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 GABBR2O75899 941 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ETS2P15036 469 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SERPINB6P35237 376 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 HARS2P49590 506 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 DEUP1Q05D60 604 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TRIP10Q15642 601 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PKDCCQ504Y2 493 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 ARNTL2Q8WYA1 636 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 B3GNT5Q9BYG0 378 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MTMR10Q9NXD2 777 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 PIM2Q9P1W9 311 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 TRIP11Q15643 1979 aa15.34■□□□□ 0.05
SYP-201ENST00000263233 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms