RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF844Q08AG5 666 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CRHR2Q13324 411 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DGKZQ13574 1117 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SLC29A2Q14542 456 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 KIAA0408Q6ZU52 694 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 OTULINQ96BN8 352 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM55Q9BYV6 548 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ASB3Q9Y575 518 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 BRWD3Q6RI45 1802 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 UBXN8O00124 270 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ENDOD1O94919 500 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ASGR1P07306 291 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DEFB106AQ8N104 65 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ADAM2Q99965 735 aa8.47□□□□□ -1.05
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PTPN3-201ENST00000262539 MINDY3Q9H8M7 445 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 F8VP50 259 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CAPZA2P47755 286 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CDH17Q12864 832 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 LLGL1Q15334 1064 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TMED2Q15363 201 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TAZQ16635 292 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 RTL10Q7L3V2 364 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ITIH5Q86UX2 942 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM48Q8IWZ4 208 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 HTR3CQ8WXA8 447 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PEX13Q92968 403 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CPXM1Q96SM3 734 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 NDE1Q9NXR1 346 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 A0A1W2PQ67 120 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 FGF19O95750 216 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 HMBSP08397 361 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 SLC11A2P49281 568 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 OCRLQ01968 901 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 MGAT5Q09328 741 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CBLBQ13191 982 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
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PTPN3-201ENST00000262539 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
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PTPN3-201ENST00000262539 TOX2Q96NM4 488 aa8.46□□□□□ -1.05
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PTPN3-201ENST00000262539 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ZFATQ9P243 1243 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 PADI3Q9ULW8 664 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 COL4A5P29400 1685 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPN3-201ENST00000262539 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PTGIRP43119 386 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 HK2P52789 917 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TRABDQ9H4I3 376 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 RAD18Q9NS91 495 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PFKLP17858 780 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 LAG3P18627 525 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MAGEA6P43360 314 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MMP13P45452 471 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TPGS2Q68CL5 300 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 PID1Q7Z2X4 250 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 NLRP14Q86W24 1093 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 GIPC2Q8TF65 315 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TFAP2BQ92481 460 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 GRID1Q9ULK0 1009 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 M0QYT0 321 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 NDUFB5O43674 189 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC126Q96EE4 140 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 VPS11Q9H270 941 aa8.46□□□□□ -1.06
PTPN3-201ENST00000262539 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa8.46□□□□□ -1.06
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