RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227451.3

DTX4-201, Transcript of deltex E3 ubiquitin ligase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DTX4, Length 5,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4-201ENST00000227451 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 DEFB118Q96PH6 123 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 VPS51Q9UID3 782 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 FBXO10Q9UK96 956 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MRC1P22897 1456 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ZNF839A8K0R7 811 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 GRK2P25098 689 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 OTOAQ7RTW8 1153 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 FAM136AQ96C01 138 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PANX3Q96QZ0 392 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ATRNO75882 1429 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TBC1D3BA6NDS4 549 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 RNF103O00237 685 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 GRM5P41594 1212 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CCNG1P51959 295 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ACTR8Q9H981 624 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 RAD51BO15315 384 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CHKAP35790 457 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 FBXL19Q6PCT2 694 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CYP4F12Q9HCS2 524 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SOX13Q9UN79 622 aa21.18■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 DNAJC3Q13217 504 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 RD3Q7Z3Z2 195 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PDHA1P08559 390 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 WDR93Q6P2C0 686 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 KCNMB4Q86W47 210 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 IL31RAQ8NI17 732 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PHF21AQ96BD5 680 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CCDC134Q9H6E4 229 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SPTLC1O15269 473 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MAGEB18Q96M61 343 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 LOC100653049A0A140TA62 436 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 KRT34O76011 436 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 THRAP10827 490 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 FGFR1P11362 822 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CPA3P15088 417 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CRABP2P29373 138 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 WDR59Q6PJI9 974 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TAS2R13Q9NYV9 303 aa21.17■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 KRT6AP02538 564 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 KRT6BP04259 564 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 MAPK8P45983 427 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 KRT6CP48668 564 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CORO1BQ9BR76 489 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TLL1O43897 1013 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 HDCP19113 662 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 HES2Q9Y543 173 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TISP43B9A030 160 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 BTBD19C9JJ37 291 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 TM9SF1O15321 606 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 APOC2P02655 101 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 GRK4P32298 578 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 CEP41Q9BYV8 373 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 PSMD5Q16401 504 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 DERAQ9Y315 318 aa21.16■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.15■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 GP5P40197 560 aa21.15■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 ITGA7Q13683 1181 aa21.15■□□□□ 0.98
DTX4-201ENST00000227451 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms