RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000164227.9

BCL3-201, Transcript of B cell CLL/lymphoma 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCL3, Length 2,038 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3-201ENST00000164227 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 GLUD2P49448 558 aa27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 SESN3P58005 492 aa27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 ALKAL1Q6UXT8 129 aa27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 CXCL16Q9H2A7 254 aa27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
BCL3-201ENST00000164227 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 KITP10721 976 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 GOT1P17174 413 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MATKP42679 507 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 CPA2P48052 419 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 C7orf31Q8N865 590 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 RILPQ96NA2 401 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MAGEB5Q9BZ81 275 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PLIN3O60664 434 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 LCP1P13796 627 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 CDC42EP1Q00587 391 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ARNTL2Q8WYA1 636 aa27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 NEBLO76041 1014 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 CCDC130P13994 396 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 TUBB3Q13509 450 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.972e-7■■■■■ 32.8
BCL3-201ENST00000164227 SLC25A52Q3SY17 297 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 GPAMQ9HCL2 828 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 GDAP2Q9NXN4 497 aa27.37■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 TPP1O14773 563 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 KLHL2O95198 593 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 SERPINE1P05121 402 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 LINGO3P0C6S8 592 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 GRK2P25098 689 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ADORA2BP29275 332 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ACTR3P61158 418 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ULK2Q8IYT8 1036 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ADAMTS10Q9H324 1103 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PIRO00625 290 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 CD4P01730 458 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MYL4P12829 197 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ADORA2AP29274 412 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 SLC1A6P48664 564 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 RCN2Q14257 317 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 CASC4Q6P4E1 433 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 FBXO27Q8NI29 283 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 LPIN3Q9BQK8 851 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa27.36■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MAP3K7O43318 606 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 DAB1O75553 588 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ARHGAP8P85298 464 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 KDSRQ06136 332 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PDK1Q15118 436 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 FBXO47Q5MNV8 452 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 LIMS2Q7Z4I7 341 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 LGMNQ99538 433 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 KATNBL1Q9H079 304 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 IGSF9Q9P2J2 1179 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa27.35■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 RNF103O00237 685 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MFSD11O43934 449 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 MGAT1P26572 445 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 RABGAP1LQ5R372 815 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 NOTUMQ6P988 496 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 BNIPLQ7Z465 357 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 UNC5BQ8IZJ1 945 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PYROXD2Q8N2H3 581 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 P2RY11Q96G91 374 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ZNF560Q96MR9 790 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ZNF778Q96MU6 729 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 EBF4Q9BQW3 602 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 DNAJC28Q9NX36 388 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 SOX13Q9UN79 622 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PROCP04070 461 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ITGA2BP08514 1039 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 PDHA1P08559 390 aa27.34■■□□□ 1.97
BCL3-201ENST00000164227 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms