RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tpd52l2Q9CYZ2 220 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nmnat1Q9EPA7 285 aa15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Adam17Q9Z0F8 827 aa15.98■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 9230113P08RikD3YWX3 137 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Akr1b10G5E895 316 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfy1P10925 782 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cd247P24161 164 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Emilin3P59900 758 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cntn3Q07409 1028 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Bpifb5Q3UQ05 490 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm10488Q4KL05 212 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fbxw2Q60584 422 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prr33Q8C494 260 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Spdye4bQ8CDE8 236 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PvrQ8K094 408 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gsto2Q8K2Q2 248 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cox18Q8VC74 331 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp617Q91WM0 559 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fam114a1Q9D281 569 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tsga13Q9DA17 273 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc25a19Q9DAM5 318 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fut8Q9WTS2 575 aa15.97■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp472B0V2W5 534 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Usp51B1AY15 661 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Usp4P35123 962 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Slc12a2P55012 1205 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cdo1P60334 200 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Adcy8P97490 1249 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Brms1lQ3U1T3 323 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pla2g4dQ50L43 825 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Shroom1Q5SX79 823 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nfe2l2Q60795 597 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PterQ60866 349 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 TCAIMQ66JZ4 499 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atp11bQ6DFW5 1175 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PdgfrlQ6PE55 375 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tas2r102Q7M717 329 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fbxw7Q8VBV4 629 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Thg1lQ9CY52 298 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cpxm2Q9D2L5 764 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc81Q9D5W4 654 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Capn9Q9D805 690 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 LrmdaQ9D9B4 229 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrrc46Q9DAP0 323 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Magel2Q9QZ04 1284 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cul1Q9WTX6 776 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Plxna4Q80UG2 1893 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Malrd1A2AJX4 2123 aa15.96■□□□□ 0.15
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vsig10l2A0A140LHF2 776 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rhox3fA2ANE1 215 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tmem215A7E1Z1 235 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 6030498E09RikB1AX85 169 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf518bB2RRE4 1077 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r115E9Q0E7 857 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 ShdO88834 343 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rnf10Q3UIW5 804 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rtl3Q6P1Y1 553 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trim61Q8JZK6 461 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sh2b1Q91ZM2 756 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dnajc14Q921R4 703 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Nxnl2Q9D531 156 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Oser1Q9D722 291 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Syde1Q9DBZ9 737 aa15.96■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Plxna3P70208 1872 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fam209A2APA5 170 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zscan5bB2RTN3 468 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cdh18E9Q9Q6 790 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atf6F6VAN0 656 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cd160O88875 185 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 SykP48025 629 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ppp3ccP48455 513 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 CidecP56198 239 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AxlQ00993 888 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyp2c65Q148B1 490 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Znf746Q3U133 652 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tspyl3Q3UYP3 334 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Grxcr1Q50H32 290 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 LpoQ5SW46 710 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rxfp1Q6R6I7 758 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dupd1Q8BK84 215 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 4921504E06RikQ8CET2 560 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Champ1Q8K327 802 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ces2aQ8QZR3 558 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mcoln1Q99J21 580 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Trem2Q99NH8 227 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rec114Q9CWH4 259 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 LrgukQ9D5S7 820 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dpysl5Q9EQF6 564 aa15.95■□□□□ 0.14
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.6 ms