RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc9a4Q8BUE1 797 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc26a6Q8CIW6 758 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Shank3Q4ACU6 1730 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smok4aA0JLX3 433 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Herc3A6H6S0 1050 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zar1lC3VD30 291 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm2956E9PVJ0 216 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5796E9Q7M8 205 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm5689F6Y2A6 97 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3629K7N6Y2 205 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm10340K7N708 205 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8108K7N734 216 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TxkP42682 527 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PgfP49764 158 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4933415F23RikQ14BX6 153 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ubn1Q4G0F8 1135 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Klhl17Q6TDP3 640 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DcstampQ7TNJ0 470 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CinpQ9D0V8 212 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sacm1lQ9EP69 587 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AgkQ9ESW4 421 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Man1b1A2AJ15 658 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm4841E9QAA8 417 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ptpn9O35239 593 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ap3d1O54774 1199 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TfamP40630 243 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BmxP97504 651 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Glt6d1Q2NKH9 311 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dtx3lQ3UIR3 748 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q3V0E1 1183 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd37Q61470 281 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf507Q6ZPY5 941 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp120Q8BZW4 436 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SowahcQ8C0J6 512 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nsl1Q8K305 281 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rpn1Q91YQ5 608 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rwdd4Q9CPR1 188 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Paqr5Q9DCU0 330 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Actl7bQ9QY83 418 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 DgkeQ9R1C6 564 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CpqQ9WVJ3 470 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mllt3A2AM29 569 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyp2j8G3UZ38 503 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr611K7N609 323 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr612L7N462 323 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Crhr1P35347 415 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rgs16P97428 201 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ankrd34bQ3UUF8 508 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmtc2Q56A06 836 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atg4cQ811C2 458 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp398Q8BV16 643 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SucoQ8C341 1250 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ClmnQ8C5W0 1052 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kctd20Q8CDD8 419 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fnbp1lQ8K012 605 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Scamp1Q8K021 338 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 BroxQ8K2Q7 411 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pskh1Q91YA2 424 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pmf1Q9CPV5 202 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Kdm8Q9CXT6 414 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cnot8Q9D8X5 292 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pdzd4Q9QY39 772 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pex14Q9R0A0 376 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tpk1Q9R0M5 243 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mcf2A2AEU1 1111 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 9330159F19RikD3Z623 648 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cops4O88544 406 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Capza2P47754 286 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hsd17b4P51660 735 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Apoa1Q00623 264 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q3TQQ9 903 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zbtb7bQ64321 544 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PtprcapQ64697 197 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trim45Q6PFY8 580 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rhot1Q8BG51 631 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clrn3Q8BHH8 226 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Serpinb9dQ8BMT0 377 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prpf39Q8K2Z2 665 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trim60Q8VI40 466 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Snx9Q91VH2 595 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rwdd2bQ99M03 290 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tmem79Q9D709 391 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cmtr1Q9DBC3 837 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NplQ9DCJ9 320 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc13a2Q9ES88 586 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aff4Q9ESC8 1160 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rbck1Q9WUB0 508 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Osbpl10S4R1M9 766 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35 ms