RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FFAR3	O14843	346 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAMEF4	O60810	478 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJB5	O75953	348 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ANXA6	P08133	673 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SCG2	P13521	617 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FPR1	P21462	350 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GGT5	P36269	586 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CLCN2	P51788	898 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GNAI1	P63096	354 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NOMO3	P69849	1222 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EPS8	Q12929	822 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NFATC3	Q12968	1075 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MPP3	Q13368	585 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM60	Q495X7	471 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SYT13	Q7L8C5	426 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STPG3	Q8N7X2	389 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	USP38	Q8NB14	1042 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616		Q8NFD4	153 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CUL5	Q93034	780 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FUZ	Q9BT04	418 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10A5	Q9H207	317 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	NELFA	Q9H3P2	528 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	IL21R	Q9HBE5	538 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KCND3	Q9UK17	655 aa		5.37	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RGS12	O14924	1447 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB27B	O00194	218 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PLSCR1	O15162	318 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ADCY6	O43306	1168 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN3	O60637	253 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CYP7B1	O75881	506 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC5C	O95185	931 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GOSR1	O95249	250 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MT-ND3	P03897	115 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SBK3	P0C264	359 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ACVR2A	P27037	513 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PGM1	P36871	562 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	UCP3	P55916	312 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TEF	Q10587	303 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAM15	Q13444	863 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC23B	Q15437	767 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	FCRL6	Q6DN72	434 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ANO7	Q6IWH7	933 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TBC1D5	Q92609	795 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TOX2	Q96NM4	488 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MRC1	P22897	1456 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	5.36	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	DBX1	A6NMT0	343 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK10	O43240	276 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP6R2	O75170	966 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	CFP	P27918	469 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP5D	P30049	168 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	GRM4	Q14833	912 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	VMAC	Q2NL98	169 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	KANK2	Q63ZY3	851 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		5.35	□□□□□ -1.55
EFHC1-223	ENST00000636616	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		5.35	□□□□□ -1.55

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